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蛋白质组分析的统计学意义

标准操作程序工作流程中的每个步骤的蛋白质组分析是关键数据的统计相关性。相比我们有四个较大的蛋白质组研究的数据集不同的生物样品关于主要步骤的影响,样品制备蛋白质量化,研究设计,分析,统计,验证系数的整个过程。
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测定蛋白质阵列的自体抗体剧目在自身免疫性疾病因素——个性化治疗的新方法

最近,我们提出了一个策略来识别新的标记分子特征为斑秃结合蛋白质微阵列技术使用大的cDNA表达文库(Lueking et al ., 2005)。这种策略现在应用于青少年特发性关节炎(JIA),类风湿性关节炎(RA)和多发性硬化症(MS) BMBF-funded项目。
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评估不同的解释策略发现天车在MS / MS肽碎片数据

获得高质量的MS / MS谱的现象,不能解释在典型的序列数据库搜索是众所周知的。虽然蛋白质识别成功这是手工非常艰苦的,在大多数情况下甚至不可能与任何建议蛋白质序列匹配这些光谱。第二通过搜索程序的开发来克服这个问题。我们报告在房子PTM-Explorer开发工具。
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敏感的和具体的检测小分子核糖核酸

内源性小分子核糖核酸,21 - 22元,非编码rna转录后基因调控的反应方式。microrna在开发过程中参与调控基因表达,分化、细胞增殖和细胞凋亡。Misregulation microrna的表达与一些癌症和其他疾病。我们已经开发了成百上千种microrna miScript系统实时PCR分析,sno rna, piRNAs,其他小的非编码rna。
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评估不同的RNA提取方法

新的模式生物,Macrostomum lignano海洋扁形虫,平均体重350µg,长1.2毫米。RNA-isolation optimalisation从少量的组织需求。我们的目标是孤立RNA从少量的样本材料。
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实时多重rt - pcr循环肿瘤细胞

使用CTC工具包(CellSearch™),细胞连接到摩押anti-EpCAM immunomagnetically分离,用于分析一组选定的飞行员的32实时rt - pcr基因。本研究显示多个基因表达分析的可行性从只有一个肿瘤细胞RNA分离。最重要的是,一些肿瘤特异性基因的表达分析血液样本只包含2肿瘤细胞已经成为可能。
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功能蛋白质组学的签名泛素蛋白酶体途径

我们提出初步研究结果表面上应用的新图书馆,SeraFILE™,功能特征的泛素蛋白酶体途径。重要结果:明显对比签名匹配的癌症邻近正常组织,微分的蛋白酶体池区域和监管因素,改变催化率,构象亚型抗小分子抑制剂的证据,和可溶性监管因素的证据。
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利用高速摄影技术来优化低容量分配条件

在本研究中我们使用高速摄影作为一个反馈机制来调整Nanodrop仪器分配设置提高位置分配的准确性低容量(只)下降。这些参数可以调查,与各种液体类,减少有害影响分配性能如流偏转时,卫星的形成、二次脉冲和减少变形。
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主动脉瘤的诊断外周血基因表达分析

我们报告在这项研究中,基因表达谱的外周血细胞可能允许主动脉瘤的早期检测和诊断。基因表达谱的外周血样本收集从58个人被诊断为胸主动脉瘤(例)和36个正常个体(控制)进行了分析使用数组应用生物系统公司表达系统和人类基因组调查微阵列。
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微阵列分析使用竞争杂交

在这个工作我们探索的影响野生型和单核苷酸多态性(SNP)目标的形式的浓度,温度,杂交的时候在两个组件系统的传感特性。用有限元方法模拟DNA通过微流体的扩散室的传感表面结合DNA寡核苷酸探针杂交的建模使用相应的化学反应方程假设嫁接密度低。
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