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用多元数据分析方法对13株梭状芽胞杆菌分类学的多相方法:描述一个新种的策略
在这项工作中,多元数据分析被用作一种工具,以确定从哥伦比亚土壤中分离出的13个溶剂性梭菌菌株的分类。选择这种策略是因为它能够根据其特征(变量)在个体(菌株)之间建立关系。
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deltaDOT技术无标签本征成像(LFII™)
紫外吸收作为一种检测和定量生物分子的技术是分子生物学的常规方法。LFII™是一个量子飞跃,从这种状态到一个允许有效成像分离电泳系统中的生物分子。目前的Peregrine系统是基于生物分子(如DNA和蛋白质)、小分子和较大实体(如细菌和病毒)的标准毛细管电泳(CE)。
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基于基因表达的非基因毒性化学诱发肝癌的预测和机制评估
为了促进人类癌症风险的预测和基于机制的评估,从大鼠的短期实验中获得了一个肝脏基因表达签名,以预测非基因毒性肝癌的发生。该特征被证明可以分类47种独立的化学物质,准确率为85%,远高于其他假定的早期生物标志物。
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低siRNA浓度反向转染高通量RNAi
利用短干扰RNA (siRNA)来抑制基因表达已成为分子和细胞生物学的有力工具。例如,一些应用要求使用低siRNA浓度(小于5 nM),以减少非特异性效应的可能性。我们展示了使用一种新的转染试剂HiPerFect转染试剂进行的实验数据,该试剂允许用小于5 nM的siRNA高效敲除基因。
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特征蛋白质组组分的有效捕获及其生物标记物的识别:VisualCockpit在多维色谱和质谱数据中的应用
使用VisualCockpit的交互式可视化、过滤和数据挖掘在数千个特征2D分数中快速识别。从序列标记中识别蛋白质后,在其中发现生物标志物候选物。VisualCockpit将它们的浓度(由归一化MS肽峰高总和、酶活性和免疫反应性反映)与供体条件相关联。
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简化药物发现数据流程
无论研究学科是什么,科学家都需要轻松地获得与他们的研究相关的信息。理想情况下,这种数据访问很容易。研究人员还需要“移动数据”的能力,以获得更好的视角或不同的视角。这种数据操作需要简单明了。整合不同科学学科所需要的不同观点和信息是一项相当大的挑战。
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结合免疫参数和x线数据早期预测抗结核化疗反应
20例结核患者(12例慢反应者,8例快反应者)采用直接观察的短程抗结核化疗。胸片。ELISA法检测血清中sICAM-1和suPAR, luminex技术检测TNFRs。对所选分析物进行一般判别分析,对快速反应者和慢反应者的正确分类率分别为91.66%和87,50%。支持向量机分析的分类准确率为100%。
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DNA微阵列在干细胞培养中的微生物诊断
在干细胞培养中,有传染性疾病传播给受体的可能性。供体生物制品的任何微生物污染或在制造过程中引入的微生物污染都可能对接受者造成严重危害。大多数潜在污染物是支原体和其他细菌、酵母和真菌。此外,病毒和朊病毒污染的细胞培养和“喂食”细胞也是一个常见的风险。
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RNAi中干扰素通路相关基因诱导的测定
近年来,利用短干扰RNA (siRNA)分子特异性沉默基因表达的实验方法得到了越来越广泛的应用。对于分子和细胞生物学中的所有技术,协议优化和适当控制的使用的重要性不能被高估。
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RNAi敲除基因后的全基因组分析
在这项研究中,使用高密度寡核苷酸探针阵列将sirna介导的RNAi与全基因组表达分析相结合。这种技术组合提供了大量的信息,并允许通过监测siRNA转染对基因组中每个基因的影响来优化RNAi实验。利用QIAGEN公司设计的siRNA有效地敲除CDC2。敲除后,使用Affymetrix®GeneChip®阵列进行表达分析。
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