评估不同的解释策略发现天车在MS / MS肽碎片数据

文摘
获得高质量的MS / MS谱的现象,不能解释在典型的序列数据库搜索是众所周知的。虽然蛋白质识别成功这是手工非常艰苦的,在大多数情况下甚至不可能与任何建议蛋白质序列匹配这些光谱。

第二通过搜索程序的开发来克服这个问题。在这里,我们报告我们内部开发工具PTM-Explorer (Protagen AG)、多特蒙德、德国;力量Daltonik GmbH, Bermen,德国)。两个质/ MS数据集的重组蛋白激酶(MAPK 12和13 MAPK)已经被用于评估。