rptDB;一个原型Affymetrix .rpt QC工具

Affymetrix分析产生大量复杂的数据集，需要大量的下游分析来确定具有生物学意义的结果。在开始分析之前，用户可以从对数据的仔细QC中受益，以去除可能对最终解释产生不利影响的单个芯片。

rptDB是用于分析Affymetrix表达式报告(.rpt)文件的原型数据库。报告文件广泛用于对经过hyb、scan和.cel文件生成的原始数据进行QC。通常只使用%Present call, Scale factor和管家基因的3:5比例，但还有许多其他指标对QC分析也很重要。