siRNA设计包括二级结构靶点预测

摘要

当使用sirnaduplex进行RNAi实验时，第一个关键的挑战是设计有效的siRNA。最近关于mRNA可达性与siRNAsilencing效率相关的重要性的研究使得MWG生物技术创建了一个在线设计工具，允许研究人员查看mRNA靶位点。

初步数据强调了siRNA敲除效率与mRNA靶位点的局部自由能之间的相关性。有强有力的证据表明，在siRNA设计算法中考虑mRNA二级结构将导致更有效的siRNA。