10x基因组学用新的Visium分析在FFPE组织中解锁整个转录组分析

10x Genomics, Inc. (Nasdaq: TXG)宣布将推出用于FFPE(福尔马林固定和石蜡包封)检测的新Visium空间基因表达。该产品使研究人员能够访问整个组织的整个转录组，首次在FFPE样本中实现真正的无偏倚发现。

该产品满足客户对FFPE组织块的整个转录组空间分析的需求，特别是在翻译研究领域。FFPE处理可以对核酸(如RNA)造成显著损伤，使得进行转录组分析具有挑战性。为了解决这一问题，10x Genomics开发了开创性的新化学物质，将Visium应用于FFPE组织，具有与新鲜冷冻样品相似的高灵敏度和相同的空间分辨率。该产品将组织学技术的优点与下一代测序的巨大通量和发现能力相结合，推动了临床研究的发现。

南加州大学凯克医学院、UPMC希尔曼癌症中心和欧洲威康桑格研究所等机构的研究人员已经在评估Visium用于FFPE的免疫肿瘤学和发育神经科学研究。

10x Genomics联合创始人兼首席科学官本·辛德森(Ben Hindson)说:“这是生物学的世纪，我们将继续开发工具，以前所未有的速度加速对生物学的掌握，从而促进人类健康。”“我们新的Visium空间基因表达FFPE是一项开创性的技术，将帮助科学家更好地了解生物过程和疾病。”

南加州大学洛杉矶分校凯克医学院转化基因组学教授兼主席John Carpten博士说:“这种工具的可用性将允许对档案组织切片进行空间全转录组测序，这是一个改变游戏规则的工具。”“这将为我们提供机会，评估样本中与治疗反应和结果相关的细胞状态，并以公正的方式进行评估。10x Genomics一直是一个了不起的合作伙伴，它提供了商业级的创新技术，在整个转录组水平上研究肿瘤的分子特征，并具有空间分辨率。”

FFPE样本的整个转录组分析范围的扩大为新一波高影响的研究提供了希望，这些研究使用生物库样本，涵盖从癌症到神经退行性疾病到炎症疾病等疾病领域。

Visium空间基因表达FFPE的主要特征包括:

• 无偏倚的整个转录组分析，实现真正的发现
• 完整的组织切片覆盖，消除了与预定义roi相关的分析边界
• 高细胞分辨率，每个点有1到10个细胞，取决于组织类型
• 与组织学分析兼容，允许形态背景与转录组分析重叠
• 现成的检测试剂盒，不需要专门的仪器