映射人类蛋白质组:克里斯教授的一段谈话

今年,科学庆祝映射人类蛋白质组的90%,一个已经通过的努力人类蛋白质组计划(HPP)。188金宝搏备用探索之旅我成功的壮举克里斯总教授和加拿大研究主席蛋白酶蛋白质组学和系统生物学在英属哥伦比亚大学的,和椅子C-HPP组件的高压泵。

莫莉坎贝尔:在你编辑块,你谈论如何进行“思想的差距”。你能和我们谈谈为什么有10%的缺少蛋白质差距,以及水电看起来在未来缩小差距?

克里斯整体(有限公司):缺少蛋白质可能很少在罕见的细胞表达蛋白质,组织和胎儿/时间/儿童发展阶段,或者表达量太低,挑战采样和分析;有些蛋白质化学或结构不适合当前的质谱或需要分析最近的基础设施,通常没有可用的大多数蛋白质组学实验室由于缺乏资金用于蛋白质组学。

主持人:感觉如何作为一个科学家参与了一个项目,所以很大程度上有助于我们理解人类的生活?

有限公司:令人难以置信的激动人心的!这是所有非投资的工作在我的实验室,在大多数实验室参与定义人类蛋白质组,但我觉得它是如此的重要我们做短期科学和医学的追求,在我们自己的时间。基因组学不能提供所有的答案或诊断疾病缺乏遗传基础。至关重要的是,基因组学不能提供有关疾病的信息活动和目标药物的活动。只有蛋白质组学可以这样做。

例如,促炎细胞因子和趋化因子正是监管在表达时间和细胞/组织的位置。大多数趋化因子(分子信标控制白细胞迁移和活化,是由铝或精确的蛋白水解处理修改,删除一个或少数几个氨基酸,这发生在疾病阶段激活,然后灭活细胞表面趋化因子甚至开关受体导致完全不同的信号在目标细胞。乳沟也可以产生拮抗剂,防止新的信号到达细胞的活动。但所有这些proteoforms产生完全相同的基因mRNA。因此,知道信息本身没有提供时间信息在这些趋化因子proteoforms相对和绝对水平。

解密使用的特点,通过蛋白质组学这些proteoforms作为生物标志物提供准确和及时的信息和活动性疾病活动状态病人正在经历。这是重要信息告知诊断、治疗和病人管理。因此,蛋白质组学真的拥有设计新的个人化药物的准确诊断的关键。这些分析找到可以翻译成简单的ELISA和其他测试适合部署在医院,诊断实验室,甚至床侧。我很荣幸参与这样一个值得的努力,这让我和我的实验室成员。然而,我们的工作进展更迅速、更准确地如果资金是必不可少的基础设施。

MC:你希望如何收集的数据通过高压泵影响现代医学的未来?

有限公司:蛋白质是生命的织物。我们的基因组提供的说明我们的蛋白质是如何编织在一起,形成这个惊人的复杂的挂毯,定义我们的个性。我们的个性反过来,定义了我们可能倾向于不同的疾病,老化和其他压力。像衣服,我们的面料是不断变化和适应条件变化时——就像我们需要不同的衣服在不同的季节或白天与黑夜。某些基因使我们能够快速进行这样的变更,其他基因适应较慢。在这种情况下,“慢”是一种控制方法一致性是我们的身体需要启用一个稳定的平台。它是理解这个模式,以及它如何变化,蛋白质组学所以积分为个性化理解健康和疾病和药物。

此外,此外,机器学习的正常和病理细胞表达和分布的疾病相关蛋白质proteoforms由组织学活检样本处理将变得更加准确和更快,提供更微妙的信息,可以准确的关键,早期和适当的医疗决策。