新型生物标志物可以准确检测抗体介导的肾排斥反应
鲁汶大学科学家领导的一项研究最近发现了一种8基因检测方法,可以无创地识别患有抗体介导的肾移植排斥反应的患者。研究结果发表在EBioMedicine.
通过分析同种异体肾移植活检时采集的血液样本,8基因检测检测了抗体介导的肾排斥反应的存在,在移植物功能稳定和移植物功能障碍时具有较高的诊断准确性。
目前,由于缺乏准确的非侵入性生物标志物,抗体介导的肾排斥反应的诊断依赖于侵入性活检的使用。我们采访了鲁汶大学副教授、鲁汶大学医院肾病学家Maarten Naesens博士,以了解更多关于这项研究的信息,以及8基因检测在肾移植领域可能产生的更广泛的影响。
安娜·麦克唐纳(AM):你能给我们介绍一下这项研究的背景吗?为什么识别抗体介导的肾移植排斥反应的生物标志物如此重要?
马丁·奈森(MN):抗体介导的排斥反应是同种异体肾移植失败的主要原因。抗体介导的排斥反应的诊断是在肾小球滤过率下降或出现蛋白尿时进行肾异体移植活检。由于抗体介导的排斥反应可在缺乏直接临床体征或移植物功能特征改变的情况下发生,一些中心也在固定时间点进行肾移植物活检(监测活检)。肾小球滤过率和蛋白尿是抗体介导的排斥反应的非特异性标志物,因为许多其他免疫和非免疫损伤可干扰移植物功能。基于抗体介导的排斥反应与肾移植衰竭之间的关系,以及无法重复进行有创性协议规定的活检,因此需要更准确、灵敏度和特异性更好的非侵入性诊断标志物。
AM:在识别生物标志物时,你面临的最大挑战是什么?
米歇尔。内格罗蓬特:我们遇到了一些重要的挑战。首先,我们的参考标准是活检中抗体介导的排斥反应的病理表型。由于抽样误差和观察者间的可变性,这一参考标准存在固有的缺陷。为了尽量减少观察者间的差异性,病理评估是集中的。第二,在我们的第一阶段,我们使用了非靶向全基因组筛查来检测相关基因。然而,外周血的基因信号相当微弱,这就是为什么我们必须丰富来自活检样本的基因信号。为了对每个基因转录本与抗体介导的排斥反应的相关性进行评分,使用并集成了五种不同的机器学习算法。接下来,我们必须定义一个更多选择的基因转录本列表,这在第二个派生阶段完成。这种选择是基于基因在病理生理途径中的相关性和综合机器学习工具计算的分数。为了进一步建模为“签名”,使用内部交叉验证方法评估了多个基因转录本组合。 Finally, we aimed for a robust validation, which was realized in an independent population with real-life disease prevalence and demonstrated the added value of our test on top of already available clinical information.
AM:这项研究被称为“在肾移植生物标志物发现和发展的几个方面的一个里程碑”。你能给我们概述一下原因吗?
米歇尔。内格罗蓬特:这项研究是生物标志物发现领域的一个里程碑,最重要的是其强大的内部和外部验证。在现实生活中,这种验证在其他生物标记物研究中往往缺乏,但对于临床实践中的生物标记物评估是必不可少的。其他方面是用于发现基因的非靶向全基因组筛选,而其他研究通常从选定的一组靶标开始,引入一些选择偏差。此外,我们展示了我们的生物标志物在亚临床排斥反应检测方面的性能,我们展示了临床决策的额外益处,以及在现有临床信息之上的附加价值。所有这些方面在其他生物标记物研究中往往是缺乏的。
AM:你们计划对生物标志物进行哪些进一步的临床验证?
米歇尔。内格罗蓬特:目前的研究并不是为了评估生物标志物的动力学。在接下来的前瞻性随访研究(“BECS”,BIOMARGIN europe,成人和儿童肾移植患者的双向队列研究)中,我们将评估我们的生物标志物的动力学演变,例如它的上升是否预示着排斥事件,以及它是否在治疗后再次恢复正常。此外,我们将进一步研究与结果(移植物失败)的关系。
AM:这项研究是BIOMARGIN联盟的一部分。你能告诉我们更多关于这个项目的情况吗?
米歇尔。内格罗蓬特:BIOMARGIN联盟是一个由欧盟委员会支持的项目,旨在发现和验证用于肾移植随访的强大的非侵入性生物标志物。BIOMARGIN是一个为期4年的欧洲项目(合作研究项目),于2013年3月启动,由INSERM(国家研究所Santé et de la Recherche Médicale, Pierre Marquet教授)协调,位于法国利摩日。该联盟汇集了13个互补的合作伙伴,包括来自4个欧洲成员国(法国、比利时、德国和瑞典)的3家中小企业、1家技术转让/管理公司、5家学术实验室和4家大学医院。更多信息可以在www.biomargin.eu.BIOMARGIN联盟有一个雄心勃勃但现实的目标,即通过整合多种“组学”策略,为移植临床医生提供有效且易于使用的工具,用于早期预测移植物病变和肾功能恶化,为他们提供个性化肾移植患者治疗的可能性。
Maarten Naesens接受了科技网络科学作家Anna MacDonald的采访。188金宝搏备用