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简化谱技术在微生物学实验室工作流

信贷:疾病预防控制中心,Unsplash。

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Matrix-assisted激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)已经被用来作为微生物鉴定技术十年以上克服传统生化方法的局限性,因此可以天,通常缺乏特异性。谱技术是一种软电离的方法用于质谱(MS),允许分析生物分子(如DNA,核糖体蛋白质,肽和糖类)和大型有机分子(如聚合物和其他大分子)。MALDI-TOF女士是现在最先进的技术为物种鉴定细菌,酵母,真菌,用蛋白质组学检测。

速度和精度分析,简单的样品制备,和简单的一代的结果使MALDI-TOF女士特别适合常规微生物鉴定和高吞吐量。为此,微生物样品上发现MALDI-TOF女士目标板和覆盖之前与特定的谱矩阵分析。然后将随后获得质谱匹配参考光谱库。一般女士MALDI-TOF目标板,金属,塑料或陶瓷,MALDI-TOF女士个人样本点进行分析。两种主要类型的MALDI-TOF目标板可以用女士:一次性和可重用的盘子。关键的区别是,可复用的盘子需要彻底清洁和检查在每次运行之间,而一次性目标板可以使用了。本文讨论了一次性目标板具有成本效益的优势,方便微生物识别工作流。


快速、健壮的工作流


例如在中期和高通量实验室,在医药和食品行业,快速微生物鉴定需要质量控制(QC)和交货及时推向市场,因此高效、方便、快捷的工作流是至关重要的。此外,在高度监管的行业,如医药,QC方法必须由实验室验证。常用的可重用的钢铁MALDI目标板的地方,责任在微生物学实验室,因为他们需要一个额外的清洁步骤必须经常被记录作为证据,清洁程序被跟踪审计。但是,使用一次性目标板可以支持工作流在监管环境中,如ISO 15189。


一次性目标板减轻负担的洗涤过程的验证和消除污染的风险,从先前的孤立记忆效应。因此,当使用一次性MALDI目标板,质量管理(QM)的一部分MALDI-based工作流更容易和节省时间的管理和实验室团队专注于他们的核心任务。


此外,这个现成的概念是特别有利的情况下紧急样品需要测试;例如,在食品工业中,识别微生物污染快速做出决定从市场上召回或隐瞒产品。


除了所需的额外的清洁步骤可重用目标板,一次性和可重用的工作流MALDI-TOF女士目标板相同,使它简单的转换,同时保持识别协议相同。此外,一次性目标板提供相同级别的性能作为可重用目标板。


MALDI-TOF市场,一系列一次性MALDI目标板,在不同的尺寸和材料。鲁棒性的一个重要因素MALDI-TOF女士微生物识别是目标板表面的平整度。一些材料,如塑料,表面更容易受到轻微的变化,从而导致大规模光谱变化和需要额外的校准点。例如,目标板建立在陶瓷基地(图1),有一个完全平坦的表面,不需要预定义calibrant位置并提供灵活地应用calibrant在目标板上的任何地方,允许使用的一次性目标板。只有一个校准位置需要优秀的质量精度在整个目标板,这意味着更多的斑点是用于样品测量。此外,陶瓷材料是非常健壮的目标板不失如果他们,例如,从板凳上下降到地板上。没有限制的软件和工作流时使用一个目标板数MALDI-TOF收购目标板还没有完全充满了样品。例如,用户可以发现只有少数样本,完成MALDI跑,回来后使用免费的各自位置的目标板的新发现(和运行)。


图1:基于陶瓷可支配MALDI-TOF女士目标板。信贷:力量Daltonics。


成本的考虑


虽然一次性MALDI-TOF女士目标板块前期成本略高,没有隐藏的费用与使用或维护。相比之下,为可重用的目标板,实验室需要购买、储存、使用和处理一系列有机化合物所需的清洁过程。以及金融的影响,有机溶剂清洗需要额外的考虑,如通风柜的使用和维护,给员工额外的安全协议,和适当的处理措施。


总之,实验室需要完整的时间秩序,维护和处理这些“开销”将需要考虑直接成本与可重用目标板。此外,有机溶剂的可用性和价格波动,导致挑战那些负责实验室的库存,有时很难预测未来成本。


在样品准备


在高通量实验室,微生物学家可以节省时间等液体样品干燥可支配目标板,利用陶瓷的表面干大约10%比不锈钢板要快多了。


这些一次性盘子也合并技术,旨在提供一个围绕亲水疏水表面,样本位置或“锚”。这允许液体样品均匀在目标点位置之间没有交叉污染(图2)。避免交叉污染斑点目标板块之间对于MALDI-TOF微生物识别工作流女士是至关重要的。


这项技术尤其有用slow-drying液体样品制备的样品,这是更容易点位置之间的运行,造成交叉污染。因为滴停止蔓延在亲水疏水rim和仍在锚,是更容易为用户把样品放在液滴的目标没有任何风险跑到对方在目标板上。最后,对于特殊样本协议要求的大体积样品(如3 - 5µl)锚效应使体积集中在各自的位置没有任何交叉污染的风险。


图2:专用技术防止样本运行现货头寸陶瓷可支配目标板之间。信贷:力量Daltonics。


方便的关键


随时可用的功能,简化工作流程,导致一个节省时间的好处,使一次性MALDI-TOF女士中期目标板一个非常方便的解决方案,高通量微生物学实验室。添加增强效率和节省了时间,一次性目标板可以用现成的细菌测试标准(BTS)和中等身材HCCA(α-Cyano-4-hydroxycinnamic酸)矩阵简单,安全,快速,准确的微生物鉴定。

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