来自马里兰大学医学院的研究人员(UMSOM)基因组科学研究所(IGS)创建的处女座(人类阴道冗余基因目录):第一个阴道微生物的基因组目录。处女座已经发布作为公共资源,可以利用科学家探索微生物在妇科疾病的作用。描述其发展在最近的出版物中可用自然通讯。
卢卡生物制剂生物技术公司成立于2019年,是利用数据从处女座为广泛,开发生活biotherapeutics未满足的医疗需求在女性的健康。这包括尿路感染(尿),估计影响全球一半的女性,和早产。
188金宝搏备用最近采访了雅克·拉威尔博士(LUCA生物制剂)的首席科学家和班图语格林伍德(LUCA生物制剂的CEO)来了解更多关于阴道微生物组是什么,它如何有助于人类病理学和新疗法的发展在这个空间接近临床试验。
莫莉·坎贝尔(MC):为我们的读者可能不熟悉,你能告诉我们关于阴道微生物组是什么吗?为什么它是重要的理解微生物的遗传组成?什么是一个“最佳”阴道微生物吗?
雅克·拉威尔(小):阴道的微生物群体,代表了一个独特的环境(阴道微生物)相互作用和与宿主粘膜。bet188真人阴道微生物与人类宿主共生关系,在保持健康中扮演关键角色。一个“最优”阴道微生物往往是由四个已知的物种之一乳酸菌,发现阴道有独特的相关性。这些乳酸菌利用生产的糖原宿主粘膜生长并产生大量的乳酸,因此酸化阴道pH值小于4。这种高酸性环境规避病原体和有消炎的作用。
这么长时间,认为生态(我的低复杂度。e、微生物群组成的一个主导的乳酸菌)与最优阴道微生物群。然而,我们的探索不仅成分(低分辨率),但阴道微生物的基因表明,最优的阴道微生物群是由多个相同的菌株乳酸菌物种相互作用形成一个复杂的生态网络。
我们的工作与处女座透露有多少遗传多样性在女人的阴道微生物群,以及阴道中的细菌物种。这个新菌株的广泛理解遗传组成让我们思考如何可以提高阴道微生物组的整体功能。这种知识是改变我们的方式方法调制的阴道微生物通过microbiota-based疗法恢复和维持生态系统的保护功能,从而改变我们如何预防和治疗疾病。
主持人:研究方法通常采用什么研究阴道微生物?你能告诉我们更多关于处女座吗?
JR:大多数研究人员主要使用16 s rRNA基因测序。所有细菌核糖体蛋白质和rna组成的。一种类型的RNA, 16 s rRNA (rRNA),是由一个基因的编码序列是细菌类群之间高度保守的。扩增和测序的基因(DNA)编码核糖体RNA,科学家获得的名字和每个细菌物种存在于微生物的比例(成分)。了解微生物群的组成不提供任何信息关于它的功能——它能做什么或做什么。因此,该方法有很多局限性和描绘了一幅不完整的图景
新的sequencing-based技术和方法已经开发负担更详细的微生物和功能的理解。这些方法是宏基因组测序的遗传物质,不是只是16 s rRNA基因)和metatranscriptomics(基因表达什么,因此功能和活动执行)。换句话说,工具,给我们一个更全面的看法的细菌存在,以及他们在做什么。
由最大的阴道基因组和集成数据集metatranscriptomes迄今为止,处女座是第一个参考数据库提供gene-centric方法来描述微生物功能和阴道种内的变异。它是由大量的阴道细菌的基因组序列,通过资金的基因组测序美国国立卫生研究院的。在构建处女座,我们记录所有这些样本中发现的独特基因,达到约100万个基因。这个基因目录是高度策划这大多数基因都分配一个功能和细菌,它们的名称。
在构建处女座,我们注意到,每个物种是由基因的数量高于一个菌株的基因组编码。例如,每个应变乳酸菌crispatus,一个物种常与阴道健康发挥有益的作用,进行平均约2000个基因;然而,在处女座,乳酸菌crispatus是由超过5500个基因。这表明我们捕获大量的菌株,主要从基因组——每个贡献一套独特的基因,金额总计超过5500人。更有趣的是,在一个女人乳酸菌crispatus,我们发现平均3000个基因的物种,告诉我们,在一个女人的大量菌株乳酸菌crispatus共存。这是适用于几乎所有的物种,我们能够识别的阴道。这一发现是小说和改变我们对阴道的理解生态系统。
处女座是使用别人开发的分析自己的基因组或metatranscriptomes映射序列数据目录。这种方法是快速、计算效率比传统方法需要专业知识和大型计算机基础设施。
MC:阴道微生物参与某些病理条件?
JR:有一种强烈的迹象表明微生物组的健康状况与弹性的微生物组成和功能,或其能力破坏后回到平衡状态。我们知道失衡阴道微生物的组成可以扮演一个角色在细菌性阴道炎、泌尿道感染、艾滋病毒和性传播感染,包括衣原体或。没有一个健壮的,乳酸菌物种主导和多功能阴道微生物病原体或留有空间厌氧细菌(如细菌性阴道炎)进入或开始增长。
阴道乳酸杆菌的感染在保护中起关键作用。他们通过生产乳酸和其他物质,使环境不适合其他细菌,通过覆盖粘膜细胞病原体不能连接,并通过“坏”细菌生长所需的资源。所以,这真的是没有乳酸菌物种和厌氧细菌的存在(失调或不平衡)的阴道微生物与病理条件。标准的方法依赖于抗生素治疗对许多阴道感染可以通过禁用适得其反从长远来看我们的微生物,而不是建筑。在卢卡生物制剂,我们正在开发生活biotherapeutic产品将努力抵抗感染和增强阴道微生物来帮助保护妇女免受这些条件。
主持人:请您能告诉我们公司的创建卢卡生物制剂?伴随矩阵是什么y的目标,以及如何你用阴道微生物的遗传成分的信息吗?
班图语格林伍德(LG):卢卡生物制剂是一个生物科技公司成立于2019年8月,与任务为广泛,开发生活biotherapeutics未满足的医疗需求在女性的健康。卢卡有杠杆处女座平台识别和验证的特性,调节阴道和泌尿生殖微生物。公司的小说gene-centric模型通知的管道VMSCs(阴道微生物群稳定联盟)旨在调节阴道微生物群对疾病的预防和治疗。我们第一个目标将是复发性泌尿道感染,细菌性阴道炎,和早产出生但处女座平台提供的见解真的使我们重新评估医疗方法许多妇女的阴道健康的问题,以及未来更好的设计相应的疗法。
MC: microbiota-based疗法是什么,它们是如何制造的?
格林:Microbiota-based疗法是一种生活小说类的药物,为治疗或预防的目的提供微生物条件所影响的微生物。我们有口服益生菌补充剂市场上很长一段时间,但是生活Biotherapeutic产品(lbp)正在开发今天被认为是一个类的药物,也一样受到严格的实验室、临床和管理评估,以确保病人使用的安全性和有效性。
制造业增长通常涉及微生物在严格控制的条件下,其次是保存和集成到最终交付的格式。有各种各样的细菌、病毒,甚至是真菌,正在开发biotherapeutics生活,和制造过程是独特的。
主持人:卢卡尿生物制剂的首先药物候选目标,今年进入诊所(阶段1 b)。请您能告诉我们更多关于这些治疗及其当前状态吗?
格林:我们公司的第一个治疗将针对复发性泌尿道感染,这是估计的世界卫生组织影响全球一半的女性,在美国是最常见的细菌感染。将由临床试验哈佛医学院教师和在马萨诸塞州综合医院,预计今年开始。我们将观察的特定微生物直接阴道作为治疗的一部分。这是一个离开微生物的标准应用程序通过口服途径如益生菌补充剂,一直显示非常低水平的微生物达到阴道经过消化系统。结合改进的传递路线和理解我们从建筑获得了处女座平台,我们相信,我们的方法将提供急需的和有效的新治疗方案来影响世界各地的妇女的健康。
主持人:Microbiota-based生物制剂进行治疗。开发这类药物时安全注意事项有什么?
格林:广泛的临床前测试确认身份,执行质量、纯度、安全和功能的生活biotherapeutics之前他们曾经进入人体临床试验。这些方面都仔细检查整个发展过程中,从实验室到诊所。一些关键考虑细菌疗法尤其缺乏可转换的抗菌素耐药性基因,无毒性和non-infectivity和确认遗传身份认同的更多。
主持人:在你看来,你认为什么发展中我们将看到阴道微生物研究领域在未来五年?
JR:阴道微生物领域的研究刚刚开始从相关进展到因果关系。我兴奋的进一步发展资源像处女座,提供机械的理解微生物群是做什么,不是有什么。我们也开始理解的关键功能在阴道微生物生态系统的其他类,包括病毒和酵母。与这些观点我们可以开始落实microbe-systems方法和积极的生态转向内稳态影响健康。
格林:这个新的视角最大的影响之一是引入生活biotherapeutics替代抗生素作为标准治疗妇女的健康状况。抗生素是至关重要的在许多情况下,但他们的非特异性杀死的细菌使破坏阴道微生物容易再感染和复发的疾病。通过提供更多的医疗选择主动支持阴道微生物群我们促进预防疾病和抗生素的使用,与许多健康和卫生保健系统的积极作用。
雅克·拉威尔博士,首席科学家卢卡生物制剂,和班图语格林伍德说莫莉坎贝尔,科普作家、技术网络。188金宝搏备用
