揭示微生物群的暗物质
隔离细菌物种生活可能是一个艰难的过程,经常提出许多挑战。因此,大部分的微生物被认为是“unculturable”。然而,人们逐渐意识到,这些微生物可以培养与小说发展工具和方法的使用。
我们采访了德克Loffert博士Biomillenia的CEO,学习如何microbiome-on-a-chip技术可以帮助克服一些挑战的活细菌隔离和解开unculturable微生物受益范围的应用程序。
安娜·麦克唐纳(AM):培养的一些挑战和隔离细菌物种生活吗?
德克Loffert (DL):许多细菌物种无法轻易孤立的活着,因为他们不能复制在实验室条件下。很一般,孤立生活压力需要漫长而乏味的优化的生长介质和生长参数甚至孤立只有几株从环境或人类样本。这被称为微生物群的暗物质。
问:你能告诉我们关于Biomellenia microbiome-on-a-chip技术,以及它如何帮助这个过程吗?
DL:Biomillenia芯片上的实验室使用1亿小水滴(pl) 20日为细菌提供一个独特的生长环境,但也其他细胞或微生物。允许我们文化从一个单细胞细菌而不是散装文化或在琼脂板与标准的微生物学方法。因此,我们可以定义一个适当的环境细菌生长不与他人争夺营养和必要的辅助因子。同时,其他细菌可能会分泌物质抑制。我们附上每个细菌在一个狭小的增长空间,我们也删除这些抑制对经济增长的影响。Biomillenia的其他重要优势的技术平台的功能部署一系列不同的分析能力,这滴环境同样巨大的吞吐量1亿滴。因此,我们并不局限于一个艰难的发展优化,希望一些为数不多的几个孤立的菌株可能回应候选人在选择分析隔离产品。相比之下,我们运行数以百万计的并行文化,可以直接询问他们指定的试验选择在一个步骤有益的产品候选人从人类微生物群的巨大空间(或其他环境)。
问:什么影响可能这项技术在未来的应用,如诊断和环境监测?
DL:还有其他技术诊断和环境监测,依靠分子生物学,破坏细胞,在许多情况下适用。然而,我们的技术平台的巨大优势是隔离细菌物种存活的能力基于特定的期望特征我们可以选择。这将为产品开发提供了全新的机会在人类健康和营养、医药应用等领域,因为它允许更好地获取相关产品候选人和简单路径来分析他们的有益的作用方式。
问:你能告诉我们更多关于你最近与试剂盒的合作,和这一伙伴关系将带来的好处?
DL:尽管下一代测序更发达的技术,彻底改变了我们如何分析微生物在一个更详细的分子水平,数据分析仍然提出了重大障碍。特别是在分析菌株基因组同源性很高,现在组装算法仍然需要进一步完善和优化。参考数据依据不同的样本类型的发展是另一个主要的需要。这就是我们可以建立一个行业领先的平台技术从试剂盒将大大有助于我们标准化的生物信息学工作流产品开发以及易用性,做出数据分析非常有效的流程。我们将合作在不断改进。
问:你有什么未来的发展计划?
DL:我们已经活跃在合作伙伴项目隔离产品开发的新菌株在农业和类似的讨论在其他市场领域。在Biomillenia,我们专注于产品的开发对人类健康和营养,帮助预防生活方式疾病所引起的失调,不平衡人类微生物群。我们的平台让我们分离和分析弱势或失踪的有益影响微生物来改善健康状况。
