从动物和植物病毒,我们能学到什么?

地震袭来的克赖斯特彻奇,新西兰在午餐时间。虽然不是那么强大的六个月前,它引起的更多的破坏,导致185人丧生。坎特伯雷大学的,我当时工作的地方,幸运的是没有人员受伤或学生,只有轻微损坏的建筑。我的实验室不得不关闭了4个月,是我们研究的一个关键时刻。幸运的是,一个合作者,约翰·托马斯给我和我的研究团队另一个一个月。将我们的团队和建立一个临时实验室在布里斯班,澳大利亚是具有挑战性的,但许多公司都非常支持,提供设备,甚至贷款我们产品。例如,DNA技术集成(IDT)快速部署大量的引物对按时完成我们的项目至关重要,送一套克赖斯特彻奇家乡,复制到布里斯班,第三组是在机场等着我:没有额外的成本。这和其他的例子显示一个社区可以实现在一起面对困难,不像最近,全球一致反对COVID-19大流行。

就像现在一样,我们取得了伟大的工作在一起作为一个全球科学界。供应商也做出了贡献,例如,通过改善各种SARS-CoV-2基因组的测序引物集(重要的探测、跟踪和研究基因突变和理解病毒的进化及其显著的变异)。大流行促使世界迅速取得空前的成功开发和部署一个全新形态的疫苗,同时揭示我们的共同弱点全球相互依赖性。地震在新西兰还是中国的疾病暴发,我们更好地了解高度连接显然不同的全球生态系统。这个连接是在生态系统完成,我和我的合作者研究通过调查多样性,人口结构和病毒社区各生态系统的演化动力学。bet188真人

更具体地说,我和我的团队结合使用传统的病毒学,显微镜(包括透射电子显微镜),和分子和细胞生物学技术,结合下一代测序(上天)技术,合成生物学,生物信息学描述病毒和理解它们的动态变化。我们试图理解病毒的进化和地理传播通过研究广泛的病毒在自然栖息地。许多这些病毒并不对人类致病,甚至可以是有益的。事实上,绝大多数的病毒不会引起人类疾病的存在,因此,往往被研究者忽略。然而,这些植物和其他病毒仍然可以告诉我们很多关于病毒发展一般,以及通知研究病毒对人类是有害的。人类对病毒生态学的影响也可以显示,例如,当植物窝藏病毒从一个地区转移到另一个,新的病毒引入新的地理位置,反过来,随后影响病毒通过自然选择的进化。这样的人为行为也扩展到动物的运动,同样可以被病毒感染。这些病毒可以跳物种在人类引起人畜共患疾病。

事实上,COVID-19作为最近的一个例子人畜共患的一种疾病的起源。它是由SAR-CoV-2病毒引起的,这被认为是跳的物种从蝙蝠到人类。致病的病毒对人类只占一小部分的所有病毒存在。调查病毒动力学给了我们一个更大的病毒进化的照片,行为,主机之间传输,和地理分布。所有的这些重要元素可用于更好地理解病毒,包括那些对人类致病的,以及其他动物和植物。在大流行期间,我和我的团队从废水高通量总会在病毒基因组序列的方法调查社区SARS-CoV-2病毒的传播和流传变异的多样性。Wastewater-based流行病学(business events)提供病毒监测在社区层面,通过基因相关性和单核苷酸变异分析(SNVs),可以给我们一个全面的快照SARS-CoV-2遗传种群结构和提供疫情的预警。

总会在一个面板设计序列SARS-Cov-2 IDT SARS-Cov-2吸附研究小组采用Psomagen基因测序服务公司,我一直的长期用户,现在是IDT排列优先顺序供应商计划的一部分。踊跃参与合作伙伴的一些世界上最全面的基因组测序服务实体,在他们的承诺是一致的协作和决心打破障碍的研究。合作厂商踊跃参与和Psomagen至关重要,不仅支持研究人员在应对地震灾害像我这样在克赖斯特彻奇,但也在打击全球流感大流行的威胁。如果大流行教会了我们什么,那就是我们都是连接在复杂,有时微妙的方式。因此,它是至关重要的,我们要学会一起工作作为一个整体,不仅显然不同的研究项目,一起来给我们一个更完整的理解我们共同的生态系统——从人类病毒和超越,但也促进创新如何询问这些生物系统并最终管理负责照顾我们的地球的。