进化起源的SARS-CoV-2确认

SARS-CoV-2重建进化历史,负责COVID-19大流行的病毒,一个国际研究小组的中国、欧洲和美国科学家发现了家族的病毒已经在蝙蝠流传了几十年,可能包括其他病毒感染人类的能力。格拉斯哥大学科学家的研究做出了贡献,对未来流行病的预防产生影响源于这血统。

“冠状病毒遗传物质高度重组,意义不同地区的病毒的基因组可以来自多个来源,“Maciej Boni说,生物学副教授,宾夕法尼亚州立大学。“这使得我们很难重建SARS-CoV-2的起源。你必须确定所有的区域和跟踪他们的历史结合起来制成的。要做到这一点,我们建立一个多样化的团队与专业知识重组、系统发育约会,病毒取样,分子和病毒进化。”

该团队使用三种不同的生物信息学方法识别和移除SARS-CoV-2基因组内的重组区域。接下来,他们重建系统发育历史non-recombinant区域和相互比较,看哪个特定病毒参与重组事件在过去。他们能够重建SARS-CoV-2及其之间的进化关系最亲密的蝙蝠和穿山甲病毒。他们的发现出现在今天的自然微生物学。

研究人员发现病毒的血统SARS-CoV-2所属不同于其他蝙蝠病毒大约40 - 70年前。重要的是,尽管SARS-CoV-2基因相似RaTG13冠状病毒(大约96%),这是抽样从Rhinolophus亲近种蝠2013年在云南省,中国,研究小组发现它从RaTG13分化相对长时间前,在1969年。

“能力估计发散乘以解开后重组的历史,这是我们开发的合作,可能会导致洞察许多不同的病毒病原体的起源,”菲利普Lemey说,首席研究员的进化和计算病毒学,鲁汶。

研究小组发现,年长的特质之一SARS-CoV-2股票的亲戚是受体结合域(RBD)位于蛋白质,使病毒可以识别并结合人体细胞表面的受体。

“这意味着其他病毒能够感染人类的循环在马蹄蝙蝠在中国,”大卫·l·罗伯逊说,计算病毒学教授MRC-University格拉斯哥病毒研究中心。

将这些病毒可以直接从蝙蝠到人类还是一个中间物种需要跳跃吗?SARS-CoV-2罗伯逊说,其他研究组织错误地提出关键进化发生在穿山甲。

“SARS-CoV-2 RBD序列迄今为止只在几个穿山甲病毒被发现,”罗伯森说。”此外,其他关键特性被认为是仪器SARS-CoV-2感染人类的能力——多元突起蛋白裂解位点插入——尚未见过的另一个接近蝙蝠相对SARS-CoV-2病毒。然而,尽管可能穿山甲可能扮演了一个中间宿主SARS-CoV-2促进传播给人类,没有证据表明穿山甲感染是蝙蝠病毒进入人类的需求。相反,我们的研究表明,SARS-CoV-2可能进化的能力复制人类和上呼吸道的穿山甲。”

研究小组得出的结论是,防止未来流行病将需要更好的抽样在野生蝙蝠和人类疾病监测系统的实现能够识别新型病原体在人类和实时响应。

说:“成功的关键监测Robertson”是知道这病毒寻找和优先考虑那些容易感染人类。我们应该更好的准备第二次SARS病毒”。

Boni补充道,“我们都太迟了,对初始SARS-CoV-2爆发,但这不会是我们最后的冠状病毒大流行。更全面和实时监控系统需要到位时赶上这样的病毒数量仍然保持在两位数。”

参考
博尼,年报Lemey, P。江,x et al .进化起源的SARS-CoV-2 sarbecovirus血统负责COVID-19大流行。Nat Microbiol (2020)。https://doi.org/10.1038/s41564 - 020 - 0771 - 4

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