罗氏公司介绍下一代HLA打字454测序系统解决方案

454生命科学,罗氏公司宣布推出新GS GType HLA和即时可用性引物组高——基础中分辨率的一级和二级位点的人类白细胞抗原(HLA)基因。

引物组是设计用于与公司的台式GS初级和GS FLX下一代测序系统——启用高分辨率打字和明确的等位基因分配在一个单一的运行。

解决方案是一个重大进步的速度和质量特性的重要免疫和高度可变区域的人类基因组。包是第一个在一系列的研究分析领域的免疫遗传学,传染病,和癌症为使用454测序系统启动,让研究人员很容易平台集成到工作流应用程序特定的实验室。

免疫系统的HLA基因编码的蛋白质识别外来细胞等抗原。准确地描述个体的HLA类型研究组织移植匹配很重要,虽然这些基因变化与多种自身免疫性疾病,传染性疾病和某些癌症。

在场的HLA基因型的一个挑战由于高度多态的性质这一地区的人类基因组。传统的序列输入使用桑格毛细管电泳技术无法解决歧义和设置阶段不需要多个迭代,穿插大量的手工分析的数据,通常使用多种技术。

独特的长,克隆读取所提供的454测序系统使简单的高分辨率HLA一次输入多个样本,在许多情况下,实现明确的等位基因识别在一个序列运行。序列输出兼容第三方HLA基因分型软件工具——研究人员提供完整的解决方案从DNA基因型任务。

GS GType HLA底漆集是一个广泛的多站点的结果研究,本月发表在《组织抗原1。“我们有成千上万的样品测序并找到和合率> 99%,增加的吞吐量和显著减少歧义是比使用罗氏GS FLX系统Sanger-based方法,”伊丽莎白·特拉亨伯格说,博士,研究作者和HLA /免疫遗传学实验室的主任奥克兰儿童医院和研究中心。“使用这种方法,我们可以获得高分辨率的等位基因分配在大约三分之一的时间必要使用Sanger-based方法。”

“454测序系统提供高分辨率的一大进步,高通量HLA打字,“亨利Erlich设计解释说,博士,高级研究作者和人类遗传学部门主任罗氏分子系统。“能够快速达到如此高的精度和分辨率将产生重大影响的研究,最终,在临床应用HLA打字。”