新的一年:2013年会议承诺详细了解实验室趋势和方向

新的一年，一系列新的春季会议，有机会了解有关新技术、新方法和实验室新方向的最新细节。新的一年开始了实验室自动化和筛选学会(SLAS)会议将于1月12日至16日在佛罗里达州奥兰多举行分子医学三展2013会议将于2月11日至15日在加州旧金山举行匹兹堡会议，PITTCON 20133月17日至21日在宾夕法尼亚州费城举行。每一次会议都展示了信息学的不同方面和对LIMS的不同关注。

今年的SLAS 2013和Tri-Con 2013会议举办了一些非常有趣的信息学会议，特别是关于外部化和制药领域变化的会议。即将召开的trii - con 2013外部化会议的主席是Michael Elliot, Atrium Research & Consulting的首席执行官，电子实验室笔记本电脑(ELNs)和信息学方面的著名行业专家。

Technology Network的编辑Helen Gillespie请Elliot先生进一步阐述他的前提，即信息学正在发生去进化，以及他认为外部化是如何改变信息学格局的。

TN:你能详细解释一下什么是外化吗?你认为它是如何影响实验室的?

艾略特:外部化是追求一种完全或部分虚拟化的研究模型，将具有特定能力的合作伙伴公司集成在一起。这是影响传统研发流程的翻天覆地的变化。

从历史上看，大多数研究投资都集中在内部活动上;而发展是内部和外部支出的混合。整体生物制药研发支出持平，而外部支出每年增长超过20%，导致在3-5年内，超过一半的发现支出将用于外部服务。有些可能是以低于内部成本提供服务的承包商，有些可能拥有科学技能或技术，而其他情况则将合作伙伴紧密结合在一起，拥有共同的知识产权所有权。有一些组织和/或项目团队已经完全虚拟化;网络中的合作伙伴由一个非常小的团队协调完成实验室所需的所有任务。

这在很多方面影响了传统模式。在过去的十年里，公司已经采取了重大的——几乎是艰巨的——努力转向以项目团队为基础的研究，以打破部门障碍，加强合作。使用外部化，您不能只是走到大厅去问团队成员一个问题，在会议室与他们见面，或者让他们在饮水机旁递给您所需的数据。你必须与你的组织之外的人一起工作，他们分布在全球各地——他们中的大多数人你从未见过。这正在改变人们辛辛苦苦建立起来的合作流程。

为支持内部研究而设计的系统和流程，例如化学注册、ELN、LIMS、生物测定数据管理系统，可能不支持外部化的体系结构和安全需求。虽然内部流程为加快交付结果而进行了优化，但将这些工作放在外部会彻底改变它们，有时还会变得更糟。例如，药代动力学筛选从化合物交付到结果发布到数据仓库通常需要不到一周的时间，如果需要，项目优先级可以在中途更改。由于运输物流和结果转移的复杂性，该活动外部化可能需要两周或更长时间。虽然每次测试的分析成本可能较低，但周期时间实际上更长。由于合作伙伴可能有自己的数据管理解决方案和格式，需要进行语义和格式转换，因此数据传输可能会变得复杂。我们知道，有些组织拥有相当复杂的集成内部环境，现在可以从承包商那里接收pdf、Excel文件，甚至纸张——这是他们信息基础设施的一种权力下放。

TN:追求外部化对实验室有什么好处?

艾略特:外部化主要是为了整个组织的利益，而不仅仅是一个特定的实验室。早期，目标利益主要是财务上的——公司希望降低常规操作的成本，如文库合成和体外筛选。成本不会有很大的固定开销，而是随着项目的兴衰而变化。

在过去的几年里，我们看到了与共享基于风险的里程碑的更紧密关系的推动。公司甚至在寻求众包的方法来开发新的分子实体和解决问题。其理念是，通过一个更广泛、更多样化的专家社区，创新将被刺激，从而增加候选人才的数量。

TN:大数据在外部化中起作用了吗?

艾略特:老实说，我不喜欢“大数据”这个独立的概念。现在被认为是“大数据”的东西，明年就会变成“小数据”。这是相对的。如果你将数百个小数据集合并为一个，它不仍然只是“数据”吗?

话虽如此，我们看到越来越大的数据集，比如下一代测序产生的数据集。NGS数据必须在虚拟研究社区中分发，特别是在转化医学领域。一些制药公司希望获得早期临床试验参与者的完整DNA序列，这将产生许多pb级的数据，需要在全球范围内传输、存储和分析。在更广泛的IT社区中，有许多常见的工具可以促进大型数据的移动。几家大型制药公司正在探索它们的适用性，以及云存储和高性能计算的使用。

TN:外部化是生物技术/制药行业特有的，还是其他实验室也在利用这一趋势?

艾略特:与许多此类举措一样，生物制药处于领先地位，但我们认为它将不可避免地影响所有在研发方面投入大量资金的行业。以中国为例，中国每年毕业的理工科博士人数已经超过了美国和欧洲。虽然我们看到许多毕业生在西方工作并留在了那里，但一种趋势正在形成，许多人将回国创办自己的实验室。

企业不仅要想办法利用这一不断增长的专业知识，还要随着消费者需求的增长调整产品以适应当地需求。这就需要全面增加全球研究网络。

TN:实验室经理应该考虑的外部化的一些关键组件是什么?

艾略特:我们看到的最大错误是，在追求项目里程碑的过程中，团队在没有IT和其他运营团队参与的情况下与合作伙伴和承包商建立关系。这些组织经常感到惊讶，并被要求迅速整合承包商的数据。大多数情况下，实验室并没有从安全、访问、传输、后勤和数据转换的角度认识到问题的复杂性。试图转换来自20个不同的承包商(每个承包商都有自己的词汇表和格式)的数据是相当令人生畏的。当It部门解决所有问题时，他们已经尝试了承包商，放弃了，并被其他人取代，这并不是没有听说过的。越来越多的实验室合同经纪人加剧了这个问题。

我的建议是，不仅要从科学的角度来评估一段潜在的关系，还要考虑到它周围的一切。尽早并经常让IT参与讨论，以制定数据集成策略。如果物料(例如毒品)需要在不同地点之间转移，需要化合物管理和海关团队的参与。开发一个可支持的财务模型和衡量绩效的指标。最后，总成本和流程延迟可能比您想象的要大，超过了目标收益。

听听艾略特和其他行业领袖在即将召开的会议上的讲话。