十多年来布里斯托尔大学的世界领先的科研和生活改变为了使用高性能计算(HPC),投资超过£1600万在HPC和研究数据存储。继续会议人员处理复杂的需要和大量的数据,他们将受益于一个新的高性能计算机器,名叫BlueCrystal 4 (BC4)。设计、集成和配置的HPC、存储和数据分析积分器OCF BC4使它拥有超过15000核最大的英国大学系统核心数和理论峰值600次浮点运算的性能。
找到更多关于这个新系统,这将使工作,我们采访了西蒙•十布里斯托尔大学的高级计算主任。
BC4是什么和它如何构建系统上已经取代了吗?
与科学理论和实验,高性能计算(HPC)是现代研究的第三大支柱。布里斯托尔大学的我们有一个滚动计划不断更新,并投资于我们的HPC服务。每三年我们跟用户找到他们所需要的系统和他们想要什么和他们未来的野心。然后我们开始采购一台机器能够满足他们的需求,并提供尽可能多的力量在我们的预算。
BC4高潮的大学很多的辛勤工作和HPC OCF集成合作伙伴。团队致力于设计、集成和配置新系统与联想合作,DDN和英特尔。高度兼容BC3,我们之前的HPC集群所以我们的用户可以很容易地从现有的工作机器迁移到新系统,更强大的地区——3-4x更是如此。
除了显著更快,BC4使新的应用程序吗?
BC4包括32节点的双重Pascal p1000 NVIDIA GPU和GPU登录节点,这将改变某些研究领域。分子动力学的例如,新系统使我们能够开展更大的模拟,解决更大的问题与更大的原子系统更多的分子。
gpu很难计算使用计划,你需要重写应用程序,这是复杂和耗时的所以你需要一个好的程序员。但是,由于gpu的内在力量和芯片的并行特性的使用可以得到大幅加快/ cpu。
有特定的应用程序,就像琥珀分子动力学包和BUDE,可以利用CUDA并行计算平台和应用程序编程接口(API)模型,由Nvidia gpu。
你能告诉我们关于一些令人兴奋的研究这个新集群的支持吗?
BC4发挥了关键作用在€1.8研究埃博拉病毒,观察病毒进化的速度,和记者影响疫苗、诊断和治疗。BC4的能力是无价的研究——这是用来分析原始数据在179年的病毒病人血液样本来确定精确的病毒的基因组成。
这允许团队,由大卫·马修斯博士,高级讲师在大学病毒学检查病毒如何进化了,通知公共卫生政策等关键领域的诊断测试,部署和疫苗试验的治疗方案。
这种复杂的数据分析过程花了大约560天的超级计算机处理时间,产生九万亿个字母的基因数据以确定病毒的18000封信长所有179份血液样本的基因序列。
马修斯博士将使用BC4帮助进一步研究登革热和Zika病毒。
BC4也被作为英国生物库的一部分,基因组学研究。它的数据来自于真正的病人,其中遗传学研究有助于确定可能的常见原因的疾病通过搜索通过基因结构和关联。
你可以想象,这是计算密集型的。英国生物库招募了500000人在40 - 69岁之间从全国看,提高预防、诊断和治疗各种危及生命的疾病,包括癌症、心脏病、中风、糖尿病、关节炎、骨质疏松症、眼睛疾病,抑郁,和形式的痴呆症。
BC4将使他们更快地处理更多的数据集。
西蒙Burbridge杰克拉德说,高级编辑技术网络。188金宝搏备用
