小说中的“隐藏”基因的发现基因在哺乳动物中

优素福汗博士生在斯坦福医学院的分子和细胞生理学。他是第一个作者最近发表的一篇文章BMC遗传学概述了发现的一本小说重叠基因编码序列POLG。他的作品,结合其他研究领域,可能表明存在大量的重叠的开放阅读框架。

188金宝搏备用最近与汗更多的了解研究,基因如何被比作烹饪食谱,并意外发现可能导致一个令人兴奋的在这一领域的合作。

莫莉·坎贝尔(MC):为我们的读者可能不熟悉的基因组学、开放阅读框架和生物信息学,你能告诉我们关于你的研究的背景吗?

优素福·汗(YK):让我们来比较一下基因序列的表达和做饭。的DNA是我们的母亲食谱,它包含了每一个可能的配方,我们会需要的东西。但是当我们想准备一顿饭,我们不想弄脏我们宝贵的食谱。所以,我们将食谱存储在不同的位置(在真核生物在核基因组DNA)。当我们想做什么,我们做一个复印页面的食谱(细胞创建一个信使核糖核酸临时复制的DNA的一部分)。

这个复制的过程的一部分DNA成信使核糖核酸被称为转录。然后,我们把我们的单表我们的影印食谱(我们的信使核糖核酸),并把它回厨房(细胞的细胞质)。

在厨房里(细胞质),我们阅读影印食谱一步一个脚印。通过阅读影印食谱从第一步到最后一步(开放阅读框),我们的指令转化为结束,美味的饭。以类似的方式,信使核糖核酸机器是阅读和翻译成蛋白质的核糖体。

在传统的方式我们理解生物学、细胞想创建不同的蛋白质或者拼接不同mrna是翻译。这相当于复印食谱炒鸡蛋,煎饼,培根周一早上,然后复印一套不同的食谱(例如:土豆泥、牛排和沙拉)吃饭。

主持人:你能扩大你的最近发表的研究?你本质上发现一个“基因在基因”吗?如果是这样,这指向一个潜在的“隐藏”基因组?

即:在我们的文章中,我们发现该基因POLG创建一个信使rna,其中包含一个很长的重叠的开放阅读框。想象你下面的指示配方使烤宽面条;你从第一步开始,完成每一步直到你到达的最后一步。但是如果你从第二步开始,然后完成步骤三,四,五,六,你将创建一个汉堡包。所以编码在一个影印配方,有多种食物。

这个研究和其他已发表之前可能表明有大量的这些重叠的开放阅读框架。真正的工作是发现并描述他们!

主持人:你遇到的主要挑战是什么研究呢?

即:真正的挑战是找到这些重叠的序列。他们很难检测和将不可能做这项工作没有惊人的研究人员的支持运用。

主持人:在这个空间你的下一个步骤是什么?

即:我认为有更多的“隐性基因”。两个重要的问题是我)到底在哪里?和2)他们是如何读?

主持人:在Twitter上,你说“这个发现也由另一组在同一时间,他的手稿将不久也”——你的研究小组将寻求合作?

即:这是一个有趣的故事。我是去年9月在德国的一个会议上,我坐在观众听演讲。我的注意力开始消退,我开始翻阅抽象书看到其他研究将会在会议上提出。就在我面前,我转向完全随机页面上是几乎完全我的研究。唯一的区别是,它是由一个完全不同的群体。我惊慌失措。然而,在电子邮件从顾问的建议,我决定方法组和我们最终达成一致试图协调我们的提交。我的工作日记得更快,因此接受了他们上传手稿预印本服务器后,我告诉他们我的论文了。他们的工作是的链接在这里。

优素福Khan博士斯坦福大学医学院的研究员,莫莉坎贝尔说,科普作家、技术网络。188金宝搏备用

参考:汗et al。(2020)。依据小说重叠编码序列在POLG发起CUG启动密码子。BMC遗传学。DOI:https://doi.org/10.1186/s12863 - 020 - 0828 - 7。