EPIC-XS联盟启动

欧洲蛋白质组学基础设施联盟提供访问(EPIC-XS)是地平线2020工作计划的一部分，于2019年4月25日至26日在阿姆斯特丹举行了启动会议。这次会议汇集了世界领先的欧洲蛋白质组学专家，共同的目标是支持欧洲优秀的生命科学研究。来自所有18个成员国的代表，从青年科学家到蛋白质组学专家，都有机会在轻松非正式的环境中会面，讨论与欧洲指南相关的重要问题。

“从一个年轻科学家的角度来看，在阿姆斯特丹举行的启动会议绝对很棒。一方面，它解决了公共访问全欧洲最好的蛋白质组学设施的行政问题，同时也给人留下了在不同合作地点的当地研究活动的深刻印象。现在，我急切地等待着第一个访问项目到达我们的网站。”-Florian拜耳，德国慕尼黑工业大学博士后。

然而，为科学进步铺平道路可能具有挑战性。幸运的是，这些挑战中的一些已经在欧洲资助的蛋白质组学模拟项目PRIME-XS中得到了解决，该项目在运行了四年后于2011年结束。这一举措是成功的，因为它努力将蛋白质组学社区聚集在一起，作为一个更协调的科学蛋白质组学努力。不幸的是，它的可持续性是短暂的，它没有充分处理建立一个更加国际统一的蛋白质组学平台的问题。

为此，EPIC-XS联盟已经取得了成功，因为该社区已经将其联盟扩大到包括七个新的欧洲合作伙伴。因此，所有生命科学研究人员对最先进的蛋白质组学设施的跨国访问也从PRIME-XS的6个站点扩展到EPIC-XS的11个站点，提供了大约2400天的顶级蛋白质组学技术和无与伦比的专业知识的访问。

启动会议由来自阿尔伯特·赫克教授乌得勒支大学生物分子质谱和蛋白质组学教授，他解释了项目的起源，从2017年开始，到项目启动和2022年12月完成。他的演讲的精髓体现了所有成员都决心提供和满足目前对世界领先的设施和专业知识的需求，并通过这样做来开辟蛋白质组学的全新视角。

虽然资金可能在2022年底结束，但通过这一举措，蛋白质组学社区的可持续性将在未来继续加强和发展。这一目标是可以实现的，可以从联盟成员的传染性热情中感受到，他们自豪地展示了他们机构中现有的最先进的技术和专业知识。

虽然这个项目受到高度赞扬，但像大多数雄心勃勃的项目一样，它并非没有挑战。然而，这里的不同之处在于，许多教训是可以吸取的，而且已经吸取了PRIME-XS作为来自Raijmakers(乌得勒支大学研究支持办公室团队负责人)解释道。开展试点研究的重要性无论怎样强调都不为过，既可节省宝贵的时间和精力，又可确保申请人的期望切合实际。开放获取是关键，这是教授强调的一点克丽丝Gevaert来自弗拉姆斯生物技术研究所(VIB，根特)，他在演讲中不仅谈到了跨国获取(允许在国内和国际上提交)，而且还谈到了确保所有出版物都能在网上免费获得。

ELIXIR ESFRI社区还讨论了数据的开放访问。这个生物信息蛋白质组学联盟，由EPIC-XS合作伙伴教授领导Juan Antonio Vizcaino(embl -欧洲生物信息学研究所蛋白质组学组长，英国)教授奥利弗Kohlbacher(埃伯哈德卡尔大学Tübingen，德国)，教授Lennart Martens(VIB，根特)和他们在开赛前一天会面，讨论“蛋白质组学隐私:临床蛋白质组学数据中的再识别风险和对蛋白质组学数据管理的影响”。

这次会议是公开讨论和记录与临床蛋白质组学数据相关的隐私问题的第一步，这是研究DNA/RNA测序数据的研究人员所熟知的话题。然而，直到最近，蛋白质组学领域才开始出现类似的担忧。其中一些与最近执行2018年5月记录的《欧盟通用数据保护条例》指南有关。随着蛋白质组覆盖范围的增加，针对个性化蛋白质组数据库的搜索和容错数据库搜索，变体确实可以在蛋白质组水平上进行常规识别。其他数据类型也有可能是患者可识别的，如翻译后修饰(PTM)谱和蛋白质表达水平。因此，美国和欧洲目前全面开放数据共享的政策可能需要修订。

这个项目在克服挑战方面的雄心再次反映在令人印象深刻的前沿联合研究活动(JRA)中。这四个JRA:

• “计算蛋白质组学和跨组学集成”，由Lennart Martens教授(VIB，根特)提出
  
  
• “未来和新兴蛋白质组学技术”，由Julia Chamot-Rooke教授，(法国巴斯德研究所)
  
  
• “翻译蛋白质组学”由助理提出Maarten Altelaar教授(乌得勒支大学)和
  
  
• “蛋白质组学组织-结构和空间蛋白质组学”，由亚历山大·莱特纳教授(瑞士联邦理工学院苏黎世分校)

建立在相关联盟成员极强的创新记录基础上，专注于为计算和结构蛋白质组学的未来发展努力设计新的方法，以及解决更具挑战性的课题，包括单细胞蛋白质组学、交联质谱、高阶蛋白质组学组织、多组学集成、原生蛋白质组学、转化/临床蛋白质组学和个性化/精准医疗。这些JRA还将解决由蛋白质组学方法生成的过多数据集所产生的后勤障碍。

“很高兴认识EPIC-XS社区，我们有这么多的专业知识，期待着为蛋白质组学研究的重大进展做出贡献。”-Charlotte Stadler，博士，瑞典斯德哥尔摩科学实验室。

蛋白质组学社区也将通过培训课程和研讨会从该领域的专业知识中受益。这些研讨会中的第一个，与FEBS染色质蛋白质组学一起组织，将于今年9月在希腊举行。更多信息可以在这里找到在这里．

EPIC-XS联盟的成员可以为他们参与了这样一个协调一致的欧洲努力而感到自豪，如果启动会议表明了其蛋白质组学专家的承诺，那么全球生命科学研究有一个非常光明和可持续的未来。

提交的材料和进一步的信息可以在这里找到在这里．

“欧洲蛋白质组学基础设施联盟(EPIC-XS)的启动会议汇集了欧洲最好的蛋白质组学实验室和研究人员。会议气氛非常积极，大家都有一种将最先进的蛋白质组学带到欧洲研究界的共同承诺。我特别喜欢的是对联合研究活动的关注，其明确的目标是制定跨访问站点的最佳实践和实施方案，为欧盟和相关国家的所有研究人员提供跨国访问。”- - -Jesper Olsen教授，丹麦哥本哈根大学。

*联盟成员:法国巴斯德研究所(IP);瑞典皇家理工学院(KTH)，希腊希腊研究与技术基金会(FORTH);苏黎世联邦理工学院(ETH/FGCZ);德国慕尼黑工业大学;挪威卑尔根大学;爱沙尼亚塔尔图大学;丹麦哥本哈根大学;根特佛兰德生物技术研究所;英国欧洲生物信息学研究所;奥地利分子病理学研究所; Utrecht University (UU); European Institute of Oncology, Italy (IEO); Institute of Microbiology, Czech Republic (IMIC/CEITEC); University of Cambridge, UK (UCAM); Spanish National Cancer Research Centre (CNIO); Centre for Genomic Regulation (Spain) (CRG); Eberhard Karl’s University Tübingen, Germany (EKUT).