防治作物感染
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甜菜生产的糖占全球供应的20%。甜菜白粉病(Erysiphe betae)可导致糖产量损失高达20%。目前，为了减少甜菜白粉病的影响，主要的方法是杀菌剂处理和一系列部分抗性品种。然而，尽管每年都对E. betae流行率进行调查，但对该病的多样性、感染来源和在杀真菌治疗后再次感染的菌株知之甚少。
为了提高我们对这种真菌感染的理解，TGAC的植物和微生物基因组学组已经从英国甜菜研究组织获得了10万英镑的奖励。为了更详细地讨论这笔资金和丹毒betae，我们采访了TGAC植物和微生物基因组学副研究员Lawrence Percival-Alwyn博士。
JR: TGAC最近获得了10万英镑的奖励，用于确定英国甜菜作物的感染源和再感染源。在英国，感染甜菜的一些主要疾病是什么?它们目前是如何处理的?
LP:甜菜很容易受到许多病原体的影响，这些病原体严重限制了甜菜的产量和质量。已知对英国甜菜生产造成重大问题的病原体分为三类:
真菌:白尾霉、甜菜丹毒、白尾霉和白枝霉，分别引起白尾霉叶斑病、白粉病、甜菜锈病和白枝霉叶斑病。这些甜菜叶片真菌病通常通过种植抗性品种、轮作或使用杀菌剂来控制。我们的项目是研究E. betae和在较小程度上U. beticola。
病毒:病毒黄:一组由蚜虫传播的病毒性疾病，包括甜菜黄病毒，甜菜轻度变黄病毒和甜菜褪绿病毒，导致叶子变黄和变厚。通过钻孔种子和杀虫处理以及良好的农场卫生规范来减少蚜虫媒介，可以控制该病。“狂根病”是甜菜的一种严重病害，由甜菜坏死黄静脉病毒(BNYVV)引起，该病毒由甜菜多粘菌(Polymyxa betae)传播。对该病的管理是通过部分耐药品种。
线虫:甜菜囊肿线虫(Beet cystic Nematode, BCN)是世界范围内甜菜的主要害虫。它侵入根部，阻碍它们的生长。有BCN耐受性的品种，其中抗性已从野生品种培育到现代甜菜品系。
JR: TGAC最近获得了10万英镑的奖励，用于确定英国甜菜作物的感染源和再感染源。在英国，感染甜菜的一些主要疾病是什么?它们目前是如何处理的?
LP:甜菜很容易受到许多病原体的影响，这些病原体严重限制了甜菜的产量和质量。已知对英国甜菜生产造成重大问题的病原体分为三类:
真菌:白尾霉、甜菜丹毒、白尾霉和白枝霉，分别引起白尾霉叶斑病、白粉病、甜菜锈病和白枝霉叶斑病。这些甜菜叶片真菌病通常通过种植抗性品种、轮作或使用杀菌剂来控制。我们的项目是研究E. betae和在较小程度上U. beticola。
病毒:病毒黄:一组由蚜虫传播的病毒性疾病，包括甜菜黄病毒，甜菜轻度变黄病毒和甜菜褪绿病毒，导致叶子变黄和变厚。通过钻孔种子和杀虫处理以及良好的农场卫生规范来减少蚜虫媒介，可以控制该病。“狂根病”是甜菜的一种严重病害，由甜菜坏死黄静脉病毒(BNYVV)引起，该病毒由甜菜多粘菌(Polymyxa betae)传播。对该病的管理是通过部分耐药品种。
线虫:甜菜囊肿线虫(Beet cystic Nematode, BCN)是世界范围内甜菜的主要害虫。它侵入根部，阻碍它们的生长。有BCN耐受性的品种，其中抗性已从野生品种培育到现代甜菜品系。
JR:你的研究的一个关键目标是设计一种可以使甜菜产量减少20%的白粉病E. betae的快速检测试验。E. betae的流行程度如何?该测试将如何帮助减少该疾病的影响?
LP: E. betae的流行程度取决于冬季的严重程度，因为温和的冬季会大大增加这种病原体在接下来的夏季的发病率。由于2014/2015年冬季较冷，今年的预测预测只有22%的作物面临风险，而前一年有56%的作物面临风险。
目前，我们既不清楚杀菌剂处理和作物品种如何影响不同甜菜E. betae品种的成功。这一点尤其重要，因为目前正在审查三唑-蛋黄素杀菌剂的某些使用，因为人们担心其对人体内分泌系统产生不利影响。
通过研究杀菌剂处理前后农业环境中甜菜E. betae感染的多样性，我们将提高我们对处理后再次感染甜菜的病原体种族的理解。鉴定与杀真菌剂抗性/耐受性相关的甜菜E. betae株系将改善病害预测，并为杀真菌治疗和品种选择提供信息。基于基因组变异信息，设计基于dna的快速检测方案。这将有助于早期发现和菌株鉴定E. betae。该检测系统结合对病原体种群动态和毒力演化的了解，将有助于疾病预测模型的改进。这反过来又可以用来影响杀菌剂应用的决策。
JR: TGAC还计划生成另一种甜菜病原体beticola的基因组组装草案。关于致病因子我们已经知道了什么，你希望通过研究它的基因组来发现什么?
LP:尽管对U. beticola感染的症状有很好的描述，但对该物种的基因组知之甚少。锈病真菌的生命周期是所有真菌中最复杂的。在一个复杂的生命周期中，锈病可以有多达五种不同的孢子，可能涉及在一年中的不同时间在不同的宿主上生长。复杂的生命周期加上它们专性的生物营养生活方式使得对锈病的基础研究变得困难。
通过生成U. beticola的基因组组装草图，我们希望为进一步加强我们对宿主/病原体相互作用的分子机制的理解铺平道路。其中一种方法是使用比较基因组学和效应物挖掘来识别候选病原体效应物，用于帮助抑制宿主免疫反应。
LP: E. betae的流行程度取决于冬季的严重程度，因为温和的冬季会大大增加这种病原体在接下来的夏季的发病率。由于2014/2015年冬季较冷，今年的预测预测只有22%的作物面临风险，而前一年有56%的作物面临风险。
目前，我们既不清楚杀菌剂处理和作物品种如何影响不同甜菜E. betae品种的成功。这一点尤其重要，因为目前正在审查三唑-蛋黄素杀菌剂的某些使用，因为人们担心其对人体内分泌系统产生不利影响。
通过研究杀菌剂处理前后农业环境中甜菜E. betae感染的多样性，我们将提高我们对处理后再次感染甜菜的病原体种族的理解。鉴定与杀真菌剂抗性/耐受性相关的甜菜E. betae株系将改善病害预测，并为杀真菌治疗和品种选择提供信息。基于基因组变异信息，设计基于dna的快速检测方案。这将有助于早期发现和菌株鉴定E. betae。该检测系统结合对病原体种群动态和毒力演化的了解，将有助于疾病预测模型的改进。这反过来又可以用来影响杀菌剂应用的决策。
JR: TGAC还计划生成另一种甜菜病原体beticola的基因组组装草案。关于致病因子我们已经知道了什么，你希望通过研究它的基因组来发现什么?
LP:尽管对U. beticola感染的症状有很好的描述，但对该物种的基因组知之甚少。锈病真菌的生命周期是所有真菌中最复杂的。在一个复杂的生命周期中，锈病可以有多达五种不同的孢子，可能涉及在一年中的不同时间在不同的宿主上生长。复杂的生命周期加上它们专性的生物营养生活方式使得对锈病的基础研究变得困难。
通过生成U. beticola的基因组组装草图，我们希望为进一步加强我们对宿主/病原体相互作用的分子机制的理解铺平道路。其中一种方法是使用比较基因组学和效应物挖掘来识别候选病原体效应物，用于帮助抑制宿主免疫反应。
JR:完全测序的甜菜基因组最近被公布了。你能告诉我们一旦对贝塔E.基因组进行测序，发现新的抗性基因的可能性吗?
LP:目前尚不清楚工业上用于寻找抗性品种的当代白粉病抗性田间试验接种的代表性如何。通过了解病原体菌株的多样性，我们获得了必要的信息，以帮助我们改进未来的现场试验，以开发对更广泛的E. betae菌株具有抗性的品种。
在许多野生甜菜宿主(Beta vulgaris (subsp。Maritima)， Beta macrocarpa和Beta(现在的Patellifolia) patellaris)。在野外，病原体和宿主都能共同适应。这意味着野生环境可以驱动新的病原体种族的进化，但也可以促进宿主植物的抗性。一旦有了序列信息，就有可能测试野生的病原体种族和侵入栽培甜菜的病原体种族之间的联系。我们希望这项研究将为未来的研究奠定基础，以确定野生甜菜中的抗性基因，并将其培育成甜菜品种。
Lawrence percivar - alwyn博士接受了科技网络编辑Jack Rudd的采访。188金宝搏备用
LP:目前尚不清楚工业上用于寻找抗性品种的当代白粉病抗性田间试验接种的代表性如何。通过了解病原体菌株的多样性，我们获得了必要的信息，以帮助我们改进未来的现场试验，以开发对更广泛的E. betae菌株具有抗性的品种。
在许多野生甜菜宿主(Beta vulgaris (subsp。Maritima)， Beta macrocarpa和Beta(现在的Patellifolia) patellaris)。在野外，病原体和宿主都能共同适应。这意味着野生环境可以驱动新的病原体种族的进化，但也可以促进宿主植物的抗性。一旦有了序列信息，就有可能测试野生的病原体种族和侵入栽培甜菜的病原体种族之间的联系。我们希望这项研究将为未来的研究奠定基础，以确定野生甜菜中的抗性基因，并将其培育成甜菜品种。
Lawrence percivar - alwyn博士接受了科技网络编辑Jack Rudd的采访。188金宝搏备用
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