更容易搜索与GenomeCUBE®

RZPD以来发展GenomeCUBE®已经成为一个有价值的搜索引擎基因克隆。一个更新版本的GenomeCUBE®最近发起的源生物科学,一系列的新特性。

产品经理,我们跟媚兰会克隆,生物科学来源,找出一些改进和新内容,这将有利于用户。

问:你能告诉我一点关于源生物科学吗?

MB:供应商源生物科学是一个值得信赖的最先进的产品和服务的医疗和临床、生活和应用科学和生物制药行业。

我们是一个国际商业中心在4个国家和客户在90多个国家。该集团提供了一个投资组合的产品和服务,包括临床诊断、基因组学、蛋白质组学、药物发现和开发研究以及受控的环境中存储和测试服务范围广泛的市场。这些产品和服务提供了一个庞大而多样化的客户基础,包括50大制药公司,全球领先的大学和研究所,英国国民健康保险制度和其他卫生保健提供者。

集团组织的商业活动为三个部门——医疗、LifeSciences和稳定性和生物存储。

医疗保健部门包括我们的诊断服务,包括癌症和其他疾病的诊断检测和细胞学和血清学产品,包括宫颈癌筛查和血液银行血清学试剂。

LifeSciences部门提供超快的DNA测序服务和相关产品,由源生物科学的国际网络实验室和分销商的学术研究团体、生物技术和制药公司。

的稳定性和生物存储划分为药物研发提供支持,从生物标志物的发现和临床试验服务到稳定环境可控条件下样本存储和归档。

问:你能告诉我关于你的搜索引擎,GenomeCUBE®吗?

MB: GenomeCUBE®RZPD最初开发,德国中央服务单元内的人类基因组计划(DHGP),它成为全球最大的数据库基因克隆,并与许多主要国家和国际相关基因和基因组研究项目。

9月我们推出了升级版GenomeCUBE®,一个聪明的和直观地使用搜索和购买工具,使研究人员可以容易地访问数以百万计的克隆,成千上万的抗体和购买各种试剂的能力从一个来源。强大的搜索功能支持基于基因的研究材料的检索以及一个免费的基于文本的筛选所有源生物科学资源在一个步骤。

基于基因的搜索依赖于新综合”BioInfo核心数据库”合并基因和蛋白质相关信息从不同的公共数据库(例如NCBI,运用UniProt)。因此,各种标识符可以应用作为搜索条件。此外BioInfo的大规模数据库允许方便各种资源的映射,这是非常重要的我们的抗体组合。

关于克隆的映射GenomeCUBE®提供了一个独特的特点:映射基于Unigene集群连接克隆基因相关信息登记入册,取决于序列同源性的方法。新GenomeCUBE确保你会得到非常具体的搜索结果虽然我们高度扩展我们的全面克隆资源的访问。

GenomeCUBE®搜索结果以一个结构良好的方式呈现,克隆分类根据潜在的应用,让客户容易基于需求选择最合适的产品。

BioInfo数据将每月更新,以便GenomeCUBE®提供参考内容的每个产品,包括从多个公共数据库“实时”注释信息。

问:GenomeCUBE®消除了需要在互联网上搜索,从人员的反馈怎么样?

m:研究人员的反馈一直很好。最受欢迎的更新是能够应用各种搜索条件在GenomeCUBE®提供方便地访问各种资源,无论你来自哪里。不需要确定官方基因符号了,您可以简单地搜索与基因或蛋白质名称(即使是同义词),或者您可以使用不同的标识符作为中列出最常见的公共数据库。

此外,很多我们的克隆可以克隆的名字作为应用于公共数据库检索。这是高相关性的例子为我们的基因克隆的注释明确表示在不同基因组浏览器(运用,UCSC mapview)。确定适当的克隆你可以输入名称或直接加入到GenomeCUBE®和相应的克隆将会显示高亮显示的精确匹配。

在实施GenomeCUBE®我们考虑上市的代表性产品在公共数据库以及发起者的网站为了包含所有可用的信息以最合适的方式。此外,我们BioInfo数据库链接回到这些公共数据库使研究人员能够轻松地检查所有基因/蛋白相关信息。这意味着有很多公共数据库和国际财团的链接(例如NCBI, wormbase、ZFIN ORFeome合作),以及回GenomeCUBE®建立一个网络,促进导航,这个一直备受研究人员。

在大多数情况下,我们可以提供一些特定基因克隆在同一类别,允许研究人员做出明智的选择,我们为每个产品提供一个全面的数据表,提供所有相关的生物数据。

的搜索功能GenomeCUBE®浏览我们的完整的产品组合(克隆,抗体、试剂和包)在一个步骤中,填充三个不同的选项卡显示结果为每个产品类型。工具会自动提供一个单独的数据表列表用户可能需要的相关产品。这意味着用户可以购买所有的产品,他们需要直接通过GenomeCUBE®,消除了需要在internet上搜索各种提供者,这已被研究人员使用和赞扬。

问:一个更新版本的GenomeCUBE®最近已经启动。这个提议什么改进和额外的功能?这些将如何受益用户?

MB:一个重要的额外特性提出在新GenomeCUBE®是高度扩展搜索功能。在过去的搜索功能仅限于官方基因符号和基因库登记入册,然而,在更新后的版本,你也可以使用别名搜索基因和蛋白质,使搜索更加容易。

我们还扩大了我们的各种资源的访问通过合并不同的基因和蛋白质相关标识符从最常见的公共数据库在我们全面BioInfo数据库。除了不同的标识符来自NCBI数据库(例如Entrez基因Id、基因库到达Ref.Seqs和克隆登记入册,Unigene Ids)从运用在新版本中最重要的标识符(Id,运用基因运用记录Id)可以使用。

以满足我们客户的需求正在基于蛋白质的地区我们也实现UniProt id。作为我们的C。线虫集合是相当受欢迎的我们之间建立链接的数目尽可能id和UnigeneClusters /基因符号。此外,我们构建了一个核心的microrna的数据的数据库。我们正在显示的实现资源很快就会被释放。

的巨大扩展BioInfo数据库是一个先决条件,包括主要的抗体和重组蛋白的基因基础搜索过程。使用更新版本的GenomeCUBE®客户能够识别所有相关基因克隆、抗体和蛋白在一个地方,又节省时间研究人员。

进一步改善,已是链接到特定的设置相关产品在每个产品数据表,使得顾客能够轻松订单任何工具或试剂,您所期望的用户需要,又节约宝贵的时间。

额外的“在线”搜索功能使用GenomeCUBE®我们提供批处理数据转储细节和批量搜索需求。倾倒功能使我们能够为我们的客户提供最新的克隆列表编译所有相关生物数据所需的任何特定的应用程序。批量搜索表单的基础设置复杂的项目流动结合我们的各种资源和服务由于客户´需求。

有关更多信息,请访问www.lifesciences.sourcebioscience.com

媚兰会先说安娜玛丽麦克唐纳,编辑技术网络。188金宝搏备用