探索未来的实验室信息学工具
实验室信息系统,如LIMS eln,越来越常用的实验室。我们采访了杰夫•卡特实验室软件公司的联合创始人和首席运营官Arxspan,发现COVID-19如何推动数字化和工具是如何发展中变得更加灵活和连接。
Ruairi Mackenzie (RM):参与哪些步骤转换实验室从纸质系统无纸化,基于云计算的系统?
杰夫·卡特(JC):通常会有知觉,部署一个民族解放军是一个繁琐的过程,你将花费几个月。情况并非如此(部署Arxspan系统通常在几天内完成——这就是为什么它在业内被称为“即时民族解放军”)。有三个主要阶段成功部署:
- 决定哪些数据需要在民族解放军。越来越多的企业看到的好处以及数字化新老数据(从实验后实施)。公司通常把现有的实验室笔记本变成pdf文档,可以上传到一个民族解放军。这使用户能够索引和搜索现有的数据,以及数据的新实验。我们相信这一趋势受到两个因素:因为公司有更多的时间由于COVID-19实施这些项目,还因为他们现在更有动力有他们所有的数字数据。
- 完成基本操作和后勤问题。你需要思考每个场景的贵公司计划如何使用和访问数据。例如,一个公司必须考虑用户授权;确保安全的数据访问需要访问它的人,为那些不受限制。合同研究组织(CRO)管理和数据访问也是一个重要的考虑。项目经理需要计划如何安排所有内部和外部合作伙伴的活动效率。实现这些功能很简单,只要他们被认为是提前。
- 实现。这可以在一小时内完成,这取决于复杂性。重点是培训,公司必须确保他们的团队在采取购买和使用民族解放军。过程必须强制关闭纸笔记本和完全过渡到数字系统。这是一个变更管理的问题。
RM:是什么,在你看来,最令人兴奋的进步在过去几年实验室信息学工具吗?
JC:最大的发展是现在是多么容易获得数据工具。Mestrelab这样的公司,例如,他们可以从各种各样的仪器和导出原始数据导入到数据湖,以供其他技术,像一个民族解放军。我们正在进行的项目,Mestrelab出口和处理数据,并将它直接导入到我们的民族解放军。这节省了用户大量的时间通过自动化以前费力和手动过程。在一个相关点,大多数信息系统不再是孤立的应用程序。我们现在有一个范围的api和“钩子”,允许用户将他们的技术堆栈。这意味着每个单独的软件解决方案可以彼此“交谈”,增加每个系统的力量成倍增长。这使用户能够编译一个定制的信息解决方案,与特性从一个范围的供应商,以满足其独特的需求。
最后我发现进步特别令人兴奋的是能够有更多的上下文在生物实验。在化学科学虽然民族解放军已经普遍,只是最近代表复杂的生物学构造工具如质粒、抗体和装甲防护ELN已经可用。这提供了更多的信息,使科学管理的细节在一个更具体的和有效的方法。
当然,在这一点上我也应该提到云计算的好处。虽然这不是新Arxspan(我们的系统已经从一开始云),云计算在隐私和安全的感知障碍现在普遍理解是错误的。现在广泛接受和理解云计算系统的好处。此外,更多的人正在远程和需要访问安全、集中式数据进一步推动采用基于云的系统。
RM: Arxspan有几个不同的信息工具。有没有计划要将这些整合为一个包——例如通过存储你的民族解放军在功能?
JC:所有不同的Arxspan模块已经可以在一个系统中。然而,随着Arxspan,用户可以购买任何一个独立模块的配置或可以购买各种集成的。我们致力于给客户他们需要什么来满足他们的需求。
RM:什么是最大的司机在你的客户对采用信息解决方案在实验室吗?
JC:在过去的20年里,节省的时间采用一个民族解放军已经清晰的科学家,但不一定是对业务。但是现在,通过引入的端到端数字工作流,价值主张对于合规和效率如此之高,这是一个显而易见的企业。之前,企业部署一个民族解放军跟踪IP:现在是让用户有效的成为一个事实上的标准。
杰夫•卡特是Ruairi J Mackenzie科学作家技术网络。188金宝搏备用
