启动与弗朗西斯·克里克研究所通力合作模型COVID-19(内)人之间的传播

总部位于伦敦的工程启动地狱的制定了雄心勃勃的目标。其分布式计算资源获得他们的股票和游戏公司合作,等"我开发人员Mojang和伊芙:在线创造者中国共产党游戏,他们已经部署到生产大规模可伸缩的网络环境。地狱的的目标远远超出了游戏,然而,当前COVID-19危机代表一个机会为地狱的技术提高齿轮来解决全球问题。

与研究人员的合作弗朗西斯·克里克研究所,阴间的希望利用其仿真解决方案,以太引擎更好的模型COVID-19都和人之间的传播。188金宝搏备用向地狱的业务的副总裁,咪咪Keshani找到更多。

Ruairi Mackenzie (RM):模拟扮演着什么样的角色在跟踪一个病毒的传播SARS-CoV-2吗?

咪咪Keshani(可):我想问题是,为什么我们要模型吗?一个模型是一个简化的现实,因为现实是非常复杂的,并试着找出发生了什么,我们只能看文摘的碎片。我认为帝国模型疾病传播和感染的尼尔·弗格森和他的团队建立了超过15年,可能是最详细的病毒传播模型在人群中,我们作为一个全球社区。的原因,这是一个伟大的模型来模拟场景COVID-19是因为它细节潜在干预的结果——帮助告知决策者制定的决策。他们的模型的工作方式主要是基于多智能体仿真技术,是地狱的的技术以太引擎非常适合。多代理仿真基本上是看个人的一种方式即在这种情况下,人,了解他们在一个给定的环境中相互作用。您可以创建一个复杂的宏观事件——比如疾病传播在整个社区,城市,国家,或世界。

这是看个人的能力和理解宏观的不明显的紧急行为。这就是地狱的一个有趣的问题的技术可以应用本身,因为我们有这个分布式仿真引擎;规模非常,非常大的尺寸,没有通常的额外的复杂性。那么为什么你想模拟什么呢?因为它给我们的能力模型不同的场景和做出明智的决定。

RM:你提到以太引擎很好放置推进这些模拟,但如何模型目前跑步和地狱的的技术的应用将如何改善?

可:的建模,我们讨论这个项目特别多代理仿真。但是有不同的模型可以运行,所以您可以模拟基于近似你感兴趣的元素。这将是更多的数值模拟。人们正在采取更加关注个人,看个人如何影响宏观,那是乙醚引擎是最适合的类型,然后当这些模型达到极限时,以太引擎接管扩展的复杂性。

克里克我们这里讨论的是一个模型,是多层次和多方面的,类似于Neil Ferguson在做什么。我认为他们实际上开源的代码,很快与微软合作,所以与他们合作将是我们在未来,构建出人口模型理解COVID-19传输的影响在不同的场景中。

不同的是,我们要做的是层的深入了解特定的个人在这的环境。而不是只是说有人感染或不感染,我们想说的被感染的人和他们传播的可能性更高,因为我们理解其内部生物学。我们可以做,因为我们已经创建了一个额外的模拟,而不是看道路网络或人们如何环游城市,我们模型肺网络和病毒如何传播在他们的身体。我们能做到这一点的原因是我们有一个伟大的专长克里克,合伙人保罗•贝茨和他经营的生物分子模拟实验室。

RM:什么样的数据被送入模拟吗?

可:的我们要做内部生物学模型,我们在项目的开始,因为有很多不同的方法可以把它。与流行病通常会发生的一件事是你看到开放数据的扩散。每个人都在做正确的事情和释放他们的数据集。我们看到了埃博拉病毒流行例如。有丰富的数据可供选择。但是我们不想创建另一个模型就是噪音。有很多模型乱飞,我相信你意识到很多人。

问题是,哪些是最有趣的方面?结果将提供最高的价值,这将是最有用的元素进入群体模型?我们正在建设工作我们去年在蛋白质-蛋白质之间的关系通过观察这些特定的受体在肺部,称为ACE2,工作。如果您熟悉COVID-19攻击身体的方式,你可能会遇到它。我们可以专注于交互。但总的来说,它看起来不像交互的东西决定了多么严重的人然后疾病或他们如何能够继续发送与否。

我们一直在研究本周可能更有影响力。新数据出现,我们一直在研究如何免疫系统的反应,因为这是一个关键决定因素可能个体的存活率。有趣的是当你看免疫系统,你有效地看着一种免疫细胞和病毒粒子之间的军事演习,这是一个问题,给了自己一个非常,非常多代理仿真。我们正在努力与贝茨实验室克里克数据集,他们的合作者,与开放的数据集,几乎天天出现。

构建好从一些其他的我们一直在做的事情与微软的合作伙伴。我刚才描述的这种模式,我们已经有了免疫系统野战游戏,类似于与癌症肿瘤细胞如何交互干预,或者在Minecraft成千上万的玩家互动游戏。这是一个非常多因子的问题。

RM:地狱的的模型,可以帮助我们在当前的危机?还是会更加丰富后爆发?

可:这件事在我心中是我之前提到的,而不是创建另一个模型就是噪音。我们要确保我们会把很多的辛勤的工作精力是要创建的最大的影响。我认为,不幸的是,它看起来像COVID-19不会是短暂的危机。这种病毒是在直到我们能够开发一种疫苗,这不是我们的东西,是现实的,至少在一年到18个月。那么,疫苗必须有效分配。我们希望能够做的是建立一个模型,该模型是有价值的疫苗已经准备好了的时候,和帮助支持推广工作。这是一个我们已经开始的谈话,并确保对方处理政府决策。这不仅仅是政策制定疫苗分发,但重新开放的道路网络,重新开放学校和其他设施。这将是一个多年的问题,不幸的是。因此而不是冲在短期内,我们应该创造一些与长期的价值。在接下来的几个月里

RM:看新闻,我们得到新的建模的狂轰滥炸几乎每天的数据。你有什么建议关于如何评估这些数据?

可:武汉最近出来的数据修改后的城市的死亡人数的数字上升了近50%,因为所有的其他情况下,都没有算高峰期间的危机。这些每天滚动预测数字,我们从NHS,你真的不能持有多少股票。我会给的建议是,看每天的事情,虽然感觉有价值,也许不是最丰富的方法获得了解发生了什么。看数据随着时间的推移,你会看到真正的见解和价值。一个模型只有数据进入它。和COVID-19数据出现。我的建议是看一切都带着浓重的撮盐。因为我们的理解情况仍在发展中,我们没有一个完整的画面。我们知道的是,我们现在不能信任我们的数据。

咪咪Keshani Ruairi J Mackenzie说,科学技术网络作家188金宝搏备用