科学方法和结果的验证
人群采购方法可以提供很好的机会解决科学界面临的各种挑战。这样的一个例子是菲利普莫里斯国际公司(PMI) sbv改进剂。
了解项目及其目标,我们采访了茱莉亚Hoeng博士PMI系统毒理学主管研发。
问:你能告诉我们一点关于sbv改进剂的总体目标是?
sbv改进剂代表系统生物学验证:工业过程验证研究方法论。合作计划,领导和由菲利普莫里斯国际公司(PMI),致力于开发一个健壮的方法验证的科学方法和结果。1、2开放科学的平台举办一系列挑战和事件,每个处理系统生物学的一个独特问题,以独立验证的分析方法和结果,促进复杂的数据集。
基于众包和协作竞争的原则,平台正积极推动透明度的研究流程,开放创新的科学发现在科学界和增强的对话。方法是推进科学技术的可信度和有潜力补充经典的同行评议过程更严格的评估数据集和验证的结论。
这项工作不仅有助于PMI的评估风险降低产品,产品有可能减少个人和人口风险危害香烟相比,但它还应该与其他相关行业将受益于科学方法和结果的独立评估:医药、环境风险管理和纳米技术创新,等等。
问:使用一个众包的好处是什么方法解决科学问题?
答:众包确保信誉,公正和再现性的科学结论。它可以实现这一目标,因为:
•涉及许多因素,每一个独立的方法和知识
•不同的解决方案可以应用于一个复杂的问题的各个方面
•基准测试是公正的
•调查人员可以利用“群众的智慧”:独立解决方案的结合往往比任何单个解决方案被证明是更健壮的孤独
因为这些属性crowd-souring是越来越受欢迎,在预测和验证解决科学问题。sbv改进剂是这样的一个计划。其他的包括:
•CASP(蛋白质结构预测的关键评估)
•梦想(对话逆向工程评估和方法)
•卡普里岛(预测的关键评估交互)
•FlowCAP(人口的关键评估识别方法)
•BioCreAtIvE(信息提取的关键评估系统生物学)
•知识发现(KDD)杯(知识发现和数据挖掘)
这些举措背后有两个关键原则。首先,由一个公正的评估预测,外党比自我评估是一个更严格的模型验证。其次,响应来自社区的科学挑战可以达成共识关于任务的最有建设性的方法。
问:你提到sbv完善同行评议系统可以帮助补充。你能解释一下这个吗?
答:经典的同行评议系统被广泛认为是最重要的一个质量控制机制的科学论文。然而,它也承认,系统的弱点,它是开放的错误/偏差和评论家只能评估一篇论文的结论是否支持的数据和结果,本文所示(有可能是一个很大的数据,文章的作者没有明确解决)。sbv剂能够解决这些问题,因为:
•群众的每一个成员都是公开的和他们的贡献
•所有的数据是可用的
•结论验证基于完整的数据集,而不只是由作者提出的结果
sbv改进剂的研究填补了缺口质量评估不通过古典同行评议。科学结论通过sbv改进剂是完全复制,因此可以应用与高度的信心。
问:什么挑战和事件sbv改进剂托管吗?接下来是什么?
答:自2012年以来,首次推出社区平台时,我们有四个sbv改进剂的挑战和运行,最近,一个sbv改进剂Datathon。
首届sbv改进剂Datathon 2016年9月23 - 24日在新加坡举行。团队的计算生物学家,bioinformaticians和数据科学家共享他们的知识和资源,找到新方法来满足大型、复杂的数据集。结果是一套强大的开源数据分析和可视化工具,将相关的研究科学家们在一系列不同的领域工作,以及生命科学行业和监管机构。这些工具将在适当的时候通过揭路荼平台,开放连接平台,浏览不同的应用程序提供了一个框架,在生物学和医学数据库和服务。
进一步的挑战和datathons目前正在规划。
进一步的信息在所有方面的sbv改进剂是可用的http://www.sbvimprover.com。
茱莉亚Hoeng安娜·麦克唐纳说,编辑技术网络。188金宝搏备用
关于茱莉亚Hoeng博士
茱莉亚Hoeng是PMI系统毒理学主管研发,她领导系统生物学项目,包括一个项目的投资组合在体外,体内和在网上研究产品测试。她从剑桥大学博士,博士后,一个女士在生物信息学从乔治亚理工学院,美国佐治亚州亚特兰大以及洛桑商学院的MBA学位。茱莉亚发表了很多文章和书籍章节突出毒理学的系统生物学方法的使用。
引用
1。迈耶P, Alexopoulos LG、性交T, et al。验证系统生物学研究的协同竞争的时代。自然生物技术,2011;29日(9):811 - 5
2。Meyer P, Hoeng J,大米JJ, et al。工业过程验证研究方法论(剂):对系统生物学验证。生物信息学2012;28 (9):1193 - 201
笔记
风险降低产品(“RRPs”)是我们用这个词来指现在的产品,可能会存在,或有可能出现的风险较小伤害吸烟者切换到这些产品还是继续吸烟。我们有一系列RRPs在不同的发展阶段,科学评估和商业化。因为我们RRPs燃烧烟草,不产生有害的,潜在的有害化合物的数量远低于在香烟烟雾中找到。
