选择默认的SMART模式
SMART可以在两种不同的模式下使用:正常的或基因组.主要的区别在于所使用的底层蛋白质数据库。在正常的聪明,数据库包含Swiss-Prot、SP-TrEMBL和stable Ensembl蛋白质组。在基因组聪明,只使用完全测序基因组的蛋白质组;后生动物为ensemble,其余为Swiss-Prot。基因组SMART中的完整基因组列表可在此下载.
Normal SMART中的蛋白质数据库具有显著的冗余性,即使去掉了相同的蛋白质。如果你使用SMART来探索结构域架构,或者想要在各种基因组中找到精确的结构域计数,可以考虑切换到基因组模式。域注释页面中的数字会更加准确,在架构查询结果中不会出现很多相同基因对应的蛋白质片段。不过,请记住,您正在探索的基因组是有限的。
不同的配色方案可以很容易地识别你所处的模式。
正常模式 | 基因模式 |
点击上面的图片选择你的默认模式。
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稍后,您可以通过单击“SMART MODE”标题框中的链接,或单击您的个人偏好设置(菜单中的“SETUP”链接)轻松更改模式: