蓝色大脑关系:一个开源的数据驱动的科学工具
知识共享是一个重要的推动科学进步。开放科学的方法,在一个欧洲的蓝脑计划”的创建和开源蓝脑关系,允许数据集成平台的建设。蓝脑关系使数据驱动的科学通过搜索、整合和跟踪大规模数据和模型。
EPFL蓝脑计划宣布释放其开源软件项目“蓝脑Nexus”,旨在使公平(可发现的、可访问、互操作和可重用的)数据管理原则,神经科学和广泛的科学界。EPFL开放科学计划的一部分,旨在最大限度的范围和影响的研究。
蓝脑计划的目的是建立准确、生物详细,数字重构和啮齿动物的大脑和模拟,最终人类的大脑。蓝脑关系有助于支持蓝色大脑的数据驱动建模周期的所有阶段,包括但不限于实验数据,单细胞模型、电路、模拟和验证。大脑是一个复杂的多层次的系统,是一个最大的“大数据”问题我们今天。因此,蓝脑关系是建立组织、存储和处理大量数据,支持使用广泛的用户数量。
蓝色大脑关系的核心是知识图,它充当一个数据存储库和元数据目录。也仍然是不可知论者的领域是由允许用户设计任意域,使其他科学项目(如天文学、医学研究和农业)重用蓝脑关系为核心的数据平台。蓝色大脑联系服务已经被评估项目Neuroinformatics平台融入人类的大脑。
特定于使科学进步,蓝色大脑关系的知识图将出处视为首要公民,从而促进跟踪数据的来源以及它是如何被使用的。这允许用户评估数据的质量,从而使他们能够建立信任。蓝色大脑关系的另一个关键特性是其语义搜索功能,通过搜索集成数据及其来源使科学家能够很容易地发现和访问新的相关数据。
EPFL教授肖恩•希尔说:“我们看到,几乎所有的科学都是成为数据驱动。蓝脑关系代表了经过多年的研究建立一个先进的语义数据管理平台。我们等不及要看社区将与蓝脑关系。”
蓝脑关系可以在Apache 2许可下,https://github.com/BlueBrain/nexus
塞缪尔Kerrien讨论了蓝色大脑联系和开放获取和数据来源的重要性我们采访的第二部分,你可以在这里阅读的。