细胞调节血液干细胞维护比预期的更加多样化

组织包含许多不同的细胞类型,它仍然是具有挑战性的了解相互作用和促进组织功能。现在,先进的生物信息学已使一个国际研究小组发现的复杂性和高度保护骨髓(BM)调节造血干细胞的微环境。

血干细胞能够自我更新,从而留住他们具备干细胞——以及区分,导致血液中所有的细胞类型,包括白细胞、红细胞和血小板。大英博物馆微环境或“利基”,血液干细胞的存在,对于调节血液干细胞自我更新和分化是至关重要的。然而,对利基和不同功能的细胞组成的成分。

“我们还不理解大英博物馆小众的构成和它如何集成本地和系统输入调节造血作用,”大卫·Gomez-Cabrero说KAUST bioinformatician和计算生物学家。Gomez-Cabrero发展新方法结合单细胞测序数据集来提高细胞的身份和功能的理解。单细胞技术使研究人员能够准确的基因,蛋白质和代谢物在单个细胞。

Gomez-Cabrero与西班牙研究人员我们大学联盟德瓦和应用医学研究中心进行了一个综合分析三个不同的鼠标BM利基数据集,专注于两个参与血干细胞细胞类型维护:内皮细胞和间充质基质细胞。

研究描述了如何通过整合单细胞基因表达数据(RNA单细胞测序)每一个细胞类型,作者能够解开这些利基细胞的异质性,识别多个细胞亚型和分子状态。每个子类型被定义为一组特定基因的表达,它提供了线索细胞的功能和分化阶段。总的来说,他们14内皮subclusters 11间充质subclusters特点。“我们发现了一个以前从未发现过的异质性和专业化水平的内皮细胞和骨髓间充质细胞,”Jesper Tegner说,计算生物学家和合作者。

结果在小鼠与人类BM样本相比,一些subcluster基因签名和已知的利基因素调节造血作用是守恒的。这表明生物机制定义大英博物馆微环境可能是物种之间共享,Gomez-Cabrero解释道。

进一步了解细胞的组成和监管大英博物馆微环境及其相互作用,Gomez-Cabrero和研究者Borja Saez和费利佩繁荣将继续整合其他数据模式,如表观遗传学、蛋白质组学和成像数据,分析。“一旦所有细胞类型的特点,可以更好的定义和信息交互,”他说。

参考:你们J,卡尔沃IA, Cenzano我,等。反褶积的造血干细胞微环境显示高度的专业化和保护。iScience。2022;25 (5):104225。doi:10.1016 / j.isci.2022.104225

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