在一项研究中分析了超过28000人的外显,研究人员发现,所谓的“跳跃基因”似乎是罕见的在一些儿童发育障碍。研究结果发表在自然通讯。
“跳跃基因”
DNA并不总是呆在同一个地方;一些有一个冒险的倾向,使移动基因组的习惯。这种移动碎片被称为转座子或“跳跃基因”,存在于成千上万的在我们的基因组复制。有两个类这些基因的元素;只有一个,反转位子活动,活跃在人类。1
根据目的地,转座子可以产生重大影响。转座子的插入可能导致基因失活,基因表达水平变化,甚至染色体重复。2因此,转座子与多种疾病,包括血友病和癌症。1
因此,第一作者尤金·加德纳博士和他的同事着手调查如果转座子也有发育障碍的作用。
破译发育障碍项目
破译发育障碍(DDD)项目在2010年启动,目标是提供基因诊断患有严重之前未被诊断出的儿童发育障碍,通过收集DNA和临床信息和使用最新的芯片和测序方法进行分析。这个项目的范围内,研究了转座子的角色。
加德纳和他的同事们分析了外显子组、编码序列诊断发育障碍的儿童,以及他们的父母。3他们正在寻找的外显子组的变化来源于转座子的插入——他们发现它。
“在我们的研究中,我们已经确定副本,跳进基因被确定为发展障碍的可能原因。所以就像一个基地的变化你的DNA代码会导致罕见的发育障碍,也可以转座子,”加德纳说。
从识别转座子插入的痕迹,作者能够提供基因诊断三个孩子。虽然这总是一种可能性,但尽管如此出乎他们的意料。
加德纳,解释说:“新转座子插入是如此罕见,当我们开始这项研究中,我们建立了一个粗糙的期望之间清廉10000招募患者诊断。虽然我们最终得到正确的范围,如果突变率是有点低,我们可能无法做出任何诊断。”
“虽然是好从一个基本的科学问题,最终我们的目标是帮助我们的病人甚至感觉很棒。”做出小小的贡献
接下来是什么?
这些发现在几个项目已经由DDD。“对于我来说,我认为最大的突破是项目的规模——DDD已经帮助成千上万的家庭在英国和爱尔兰理解的根本原因或孩子的障碍,”加德纳说。“这是通过临床医生和研究人员之间的强有力的伙伴关系,使双方能够更好地了解潜在的遗传发育障碍的原因。”
转座子的研究中,加德纳是希望这些发现将有积极的影响:“目前,这个结果将提供某种意义上的关闭对于孩子的发展障碍的原因,允许家长/护理员寻找其他家庭可能基于基因相关疾病报告。此外,我们的研究结果与遗传咨询可以帮助父母和未来生育的决定。”
“未来,我希望这将使临床医生相信,至少在未确诊的情况下,值得看不太常见的类型的遗传变异,如转座子,试图得到一个诊断为每一个孩子。”
尤金·加德纳博士说冬青大,编辑助理技术网络。188金宝搏备用
引用
- Hancks和室外Jr .)(2016)角色逆转录转座子插入在人类疾病。移动DNA。DOI: https://doi.org/10.1186/s13100 - 016 - 0065 - 9
- Munoz-Lopez和Garcia-Perez (2010) DNA转座子:在基因组学性质和应用。目前基因组学。DOI: https://doi.org/10.2174/138920210790886871
- 加德纳et al。(2019)的贡献retrotransposition发育障碍。自然通讯。DOI: https://doi.org/10.1038/s41467 - 019 - 12520 - y
