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海洋细菌家族可能合成新的天然产物的发现

共有1038个公开的海洋微生物群落基因(基因组)收集在215年全球分布的网站。信贷:地图瓦片©Esri。来源:GEBCO, NOAA, CHS,俄勒冈州立大学,主要研究,CSUMB,国家地理,DeLorme NAVTEQ, Esri。

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一项新的研究的研究人员瑞士联邦理工学院苏黎世(苏黎世ETH)与专家合作德研究所不熟悉德尔(ICM-CSIC),发表在著名的杂志上自然揭示了一个新的家庭的存在的海洋细菌的遗传能力,通过数量巨大的生物合成基因簇的基因组(bgc),可能会导致很多生物技术的应用程序。


家庭属于门Eremiobacterota,直到现在被认为只存在于陆地环境。然而,根据现在的工作发表,这些细菌中也发现海洋。”除了是一个非常多样化的细菌集团的一部分从一个生物合成的角度来看,这些细菌是无所不在地和大量分布在整个海洋水体、“Shinichi Sunagawa解释说,瑞士苏黎世联邦理工学院的教授和团队领导了这项研究。


卢卡斯Paoli,瑞士苏黎世联邦理工学院的研究人员和研究的第一作者,强调“家庭的一些物种可以代表6%的细菌在海洋的特定部分,相当于几百万生物体每升海水”。


这是显示通过分析水样期间收集超过1000塔拉海洋探险。总的来说,该研究小组已经发现了超过7000个家庭的生物合成基因簇-其中大部分是未知的,可以用来合成生化成分和改善生物技术过程,在其他应用程序中。

“这些结果强调知识的缺乏我们有微小的海洋生物。只有在最近几年,由于几个环球海洋活动和新的分子方法的使用,我们已经开始知道生物,基因和生物技术潜力是隐藏在皮肤下的海洋”,暴露了ICM-CSIC研究员约瑟米加索尔曾参与了这项研究。

最后,ICM-CSIC研究员西尔维亚G Acinas团队成员协调塔拉海洋运动,指出“由于集成来自不同探险的成千上万的微生物基因组,它有可能调查微生物有很大的遗传潜力,这将有助于探索新的生物活性分子”。


根据研究者,“其中一些可以用于新疗法,而其他人可以帮助改善某些生物技术过程,通过扩展,我们的生活质量在未来”。

为工业微生物,一个惊喜

微生物,尤其是细菌新陈代谢非常多样,在丰富自然的每一个角落。然而,绝大多数尚未培养或研究实验室,离开他们的代谢多样性未知。


没有文化,科学团队采取微生物排序,即DNA测序的微生物群落中包含这些海洋样品为了重建这些微生物通过生物信息学分析的基因组。bet188真人

“这就是我们如何能够重建25000海洋微生物的基因组,连同另外10000基因组之前早已存在,构成全球最大的数据库,这些社区”,庆祝ICM-CSIC研究员bet188真人巴勃罗·桑切斯

未来的研究将集中在海洋微生物的分布和功能,因为它们可能起到非常重要作用的进化和适应海洋生物圈的变化正在发生。


参考:Paoli L, Ruscheweyh黄建忠、Forneris CC等。全球海洋微生物的生物合成的潜力。自然。2022年。doi:10.1038 / s41586 - 022 - 04862 - 3

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