扩增子基于16 s rrna序列和种属鉴定

下一代测序分析16 s rRNA (rRNA)通常被用来识别细菌物种进行分类研究。细菌16 s rRNA基因包含9 hyper-variable地区相当大的序列多样性在不同种类的细菌和id可用于物种。快速测定高度复杂的细菌种群多样性通过有针对性的放大可以提供一个准确的把握在低至属分类层次结构水平。一个16 s rRNA高变的领域没有足够的序列多样性区分属。增加长度的Illumina公司MiSeq读化学,Bioo科学已扩大的共同分析第四hyper-variable域(V4)原核的16 s rRNA V1、V2和V3地区同时进行。通过简化标准化程序允许优化制备高质量、可再生的库。这种优化可以应用到不同的窗口的16 s rRNA以及其他相关的原核分类标记。
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