智利蓝贻贝(Mytilus chilensis)由于当地适应和水产养殖的中性和适应性遗传变异的对比模式

像许多海洋无脊椎动物一样，智利蓝贻贝种群被认为是大范围的，由于上层幼虫的遗传结构有限。通过测序进行基因分型的进步使适应性遗传变异的研究成为可能，这可能会识别出异常位点，从而更好地区分在不同环境中进化的种群。我们研究了来自智利南部6个地点的190个贻贝样本(4个来自Reloncaví湾，一个来自Chiloe岛，一个来自巴塔哥尼亚)，用RAD-seq获得了2165个SNP位点。891个中性位点的标本间的分化非常低(FST = 0.0051)。6个类群间的分化程度较高，假定有58个异常位点(FST = 0.1139)，表明存在局部适应的潜力。这58个离群位点的DAPC结果表明，大部分差异可归因于三个主要区域和环境:巴塔哥尼亚的极端条件，受淡水影响的内湾集合(Reloncaví区域)和外湾盐水集合(Chiloe岛)。南巴塔哥尼亚集合最明显，但排除该集合的额外离群值测试显示，内湾和外湾集合之间仍然存在适应性差异(34个候选位点，FST= 0.0886)。来自Reloncaví内湾区的4个位置的所有标记面板都出现了大面积的大流行，可能是由于相似的环境和水产养殖活动的高基因流以及较低的地理距离。然而，我们的研究结果表明，在养殖区分离内湾和外湾种群是可能的，将51%的个体分配到这些地区，为水产养殖生产的可追溯性提供了机会。本研究展示了适应性遗传变异如何应用于高基因流物种的人类繁殖和分布。