Genotyping-by-Sequencing一系列不同春大麦(大麦芽)登记入册

下一代测序技术已经成为负担得起使用排序标准的基因在基因映射研究。工作的目的是饱和的一组192年春季大麦登记入册的高密度SNP标记在Genotyping-by-Sequencing (GBS)的方法。一组来自不同来源的大麦到达代表广泛的遗传多样性和展品低连锁不平衡使它用于高分辨率研究协会映射。的确,大麦的到达之前已经与45个SSR标记基因分型,1536 Illumina公司GoldenGate标记,1935飞镖标记和9 k iSelect芯片。然而,需要更多的SNP标记的密度反映了全基因组连锁不平衡结构和单体型的多样性。GBS实验由192 -丛reduced-representation图书馆的建设及其对Illumina公司HiSeq 2000测序巷(1 x 100周期)。reference-based计算管道应用于分析20 GB的测序数据。使用GBS, 7439 bi-allelic,可以生成高质量的SNP标记。比例高(约82%)的单核苷酸多态性是固定在综合物理和遗传图谱的大麦。预计的饱和度的不同大麦登记入册的高密度GBS标记将改善定位候选基因的全基因组关联映射。 Furthermore, association mapping will provide markers linked to genes of interest that are targeted in barley breeding.