乳腺癌中长链非编码rna的敲除

传统遗传学认为蛋白质为中心，RNA被视为DNA和蛋白质之间的中间步骤。最近，在整个基因组中普遍存在转录的新证据挑战了这一观点1,2。长链非编码rna (Long noncoding RNAs, lncRNA)在不同的细胞周期中选择性表达，并在特定的细胞类型中有不同的转录，这强调了其在调节细胞规格方面的重要性。lncrna可以通过各种机制作用于转录的各个阶段，从染色质重塑，控制转录到转录后处理，例如直接结合到转录激活位点，作为转录抑制子/激活子的诱饵，或作为染色质重塑复合物的引导/支架分子5。

越来越多的研究将疾病与lncrna联系起来。然而，此类研究通常只关注于探究单个lncrna的功能。在初步研究中，我们利用细胞活力和形态学数据研究了lncRNA在乳腺细胞系MCF 10A和MDA-MB-231中下调的功能后果。使用维多利亚功能基因组学中心建立的高通量siRNA筛选协议，我们已经在细胞系和高含量成像定量变化中敲除了Dharmacon™Lincode™siRNA文库中的所有靶点(目前为2231个)。在这里，我们报告lncRNA在乳腺细胞系中敲低的功能后果，并与患者肿瘤数据相关。