NEXTflex™qRNA-Seq分子索引ChIP-Seq和RNA-Seq™

大多数下一代测序(上天)图书馆准备方法引入序列偏差使用酶处理和分裂步骤可能引入错误的形式不正确的拷贝数序列和歪曲。与分子索引库,每个分子与分子标记指数从~ 10000随机选择组合,任何两个相同的分子成为区分(10000/1)的几率,并且可以独立评估在以后的数据分析。分析使用分子索引提供了一个绝对数字测量基因表达水平,无论放大扭曲中观察到许多RNA-Seq实验。在高测序深度,每个分子可以区分和整个图书馆可以提供每个分子的绝对数字分析。这种类型的索引不需要额外的步骤RNA-Seq工作流和增加下游的精度分析。解决个人的分子克隆提高测序准确性至关重要,测量偏差,PCR重复率和识别复杂的样本类型的突变。实现这一目标,我们提出了使用的分子指标RNA-Seq实验。我们使用了拟南芥测试NEXTflex™qRNA-Seq™工具作为一种新颖的高通量基因表达分析的工具。我们系nf-yc3晚开花的表型特征,4、9三突变体绝对已知基因表达水平的球员在这个突变背景光周期开花途径。结果:光周期开花的中央监管机构中心,开花轨迹T WT植物表现出更高的基因表达水平比nf-yc三突变体植物。 Consequently, downstream targets, LEAFY and APETALA 1 showed reduce gene expression levels in nf-yc triple mutant plants resulting in a delayed floral response. Conclusion: Gene expression profiles produced by the NEXTflex™ qRNA-Seq™ system rival the sensitivity of qRT-PCR and microarray expression analysis methods without losing the capability to analyze traditional RNA-Seq data.