PredRet:通过多种色谱系统之间的直接映射来预测保留时间

代谢组学研究的需求一直是开发MS谱库1,2和自动化工具以帮助化合物鉴定3 - 5的关键动力。但是，只利用碎片忽略了LC-MS中一半的可用信息。保留时间(RT)同样重要。
对于LC系统，目前没有协调的努力来共享和利用有关RT的信息。RT信息被忽视的原因是RT是特定于色谱系统(CS)的，并且没有商定的RT参考文献。
因此，开发了不同CSs中的复合RTs数据库。对于每一对CSs，使用RTs构建两个CSs中的RTs之间的投影模型。在所有CSs之间建立这些模型可以预测CSs中大量化合物的RTs，这些化合物还没有经过实验确定。
使用目前的小型数据库，可以预测多达400个RTs，根据CS的不同，中位误差在0.01到0.11分钟之间。预测置信区间的中位数宽度为0.1至0.8分钟。
这个免费、开源、基于网络的工具可以在predret.org上找到。