安捷伦增加遗传协会和拷贝数变异分析生物信息学软件
安捷伦科技公司引入了GeneSpring GX 11日最新一代的桌面软件观察和分析微阵列数据,和GeneSpring工作组11日企业版本的GeneSpring桌面软件。
旨在支持multi-omics研究GeneSpring 11添加使用pcr基因关联分析数据的功能,基因拷贝数分析和其他分析和可视化工具来促进这些异构数据的比较。安捷伦的生物信息学组合还包括质量分析器专业,建立在与GeneSpring相同的平台,支持蛋白质组学和代谢组学数据分析。
“multi-omics方法定义疾病的机制在系统生物学的研究创造了一个生物信息学瓶颈,从数据中提取生物知识的能力往往落后于生成数据的能力,”Chris Grimley说安捷伦营销高级总监,基因组学。“GeneSpring 11开发这个瓶颈和地址的一些挑战综合分析。”
“GeneSpring 11代表一个重大推进生命科学的数据分析软件,”布鲁斯Aronow说,博士,医学科学中心主任计算在辛辛那提儿童医院医学中心,并长期GeneSpring用户。“第一次在这里,我们看到一个四轮驱动机multi-omics技术,塑造一个新的综合系统生物学路线图。”
GeneSpring 11中,研究人员可以有多个实验类型,如微、基因表达、基因分型、拷贝数,同时打开在一个窗口。这允许用户之间来回移动所需的数据,而不必分别加载每个实验。此功能还允许研究人员方便地组合在一个逻辑单元数据和比较不同实验的结果类型。
GeneSpring 11还允许研究人员找到关键的联系以及它们之间的一致性。
虽然有其他软件应用程序支持multi-omics数据分析的一个主要区别GeneSpring 11的用户可以比较他们可以执行的异构数据和深度生物情境化。数据比较的关键工具是新的基因组浏览器,那里的研究人员可以画出多个数据类型作为跟踪相同的观点,和合并跟踪覆盖不同的数据类型。例如,研究人员可以覆盖拷贝数和基因表达数据评估的一致性,或覆盖拷贝数数据和microRNA追踪是否关键microRNA在放大或删除区域。
自动翻译的探测器在不同微阵列平台和生物允许研究人员比较结果通过简单的拖拽功能维恩图。这种无缝的翻译还允许研究人员快速识别实体列表,共享一个显著内容重叠。这种易于勘探数据允许快速发现药物治疗,疾病,或其他实验生物资料和相似的因素,因此,可以共享同样的潜在机制。
GeneSpring 11继续发展其强度在生物情境化通过扩展其网络分析工具的功能。提供的一套算法结合organism-specific通路相互作用数据库使研究人员能够产生一系列的网络类型和动态探索生化网络描绘他们感兴趣的实体之间的交互。
GeneSpring 11增加能力的研究人员使用网格生成网络作为输入。例如,研究人员可以使用“心力衰竭”作为输入网格和网络包含交互与心脏衰竭是自动生成的。研究人员可以确定他们的基因表达数据与这种疾病网络相交。
释放GeneSpring工作组11还增加了两个网络客户的企业级产品,与中央数据库存储multi-omics数据。数据浏览器提供了一个接口,用户可以搜索实验和样品存储在工作组的数据库使用可配置搜索字段。相关数据文件可以下载,并从GeneSpring可以发布静态图像。
Web客户端允许用户动态可视化并探索实验和结果存储在工作组中使用所有可用视图和情节GeneSpring通过一个网络接口。用多种方式来访问存储数据,工作组为科学家们提供了一个有效的方式协作和共享分析结果和知识。
旨在支持multi-omics研究GeneSpring 11添加使用pcr基因关联分析数据的功能,基因拷贝数分析和其他分析和可视化工具来促进这些异构数据的比较。安捷伦的生物信息学组合还包括质量分析器专业,建立在与GeneSpring相同的平台,支持蛋白质组学和代谢组学数据分析。
“multi-omics方法定义疾病的机制在系统生物学的研究创造了一个生物信息学瓶颈,从数据中提取生物知识的能力往往落后于生成数据的能力,”Chris Grimley说安捷伦营销高级总监,基因组学。“GeneSpring 11开发这个瓶颈和地址的一些挑战综合分析。”
“GeneSpring 11代表一个重大推进生命科学的数据分析软件,”布鲁斯Aronow说,博士,医学科学中心主任计算在辛辛那提儿童医院医学中心,并长期GeneSpring用户。“第一次在这里,我们看到一个四轮驱动机multi-omics技术,塑造一个新的综合系统生物学路线图。”
GeneSpring 11中,研究人员可以有多个实验类型,如微、基因表达、基因分型、拷贝数,同时打开在一个窗口。这允许用户之间来回移动所需的数据,而不必分别加载每个实验。此功能还允许研究人员方便地组合在一个逻辑单元数据和比较不同实验的结果类型。
GeneSpring 11还允许研究人员找到关键的联系以及它们之间的一致性。
虽然有其他软件应用程序支持multi-omics数据分析的一个主要区别GeneSpring 11的用户可以比较他们可以执行的异构数据和深度生物情境化。数据比较的关键工具是新的基因组浏览器,那里的研究人员可以画出多个数据类型作为跟踪相同的观点,和合并跟踪覆盖不同的数据类型。例如,研究人员可以覆盖拷贝数和基因表达数据评估的一致性,或覆盖拷贝数数据和microRNA追踪是否关键microRNA在放大或删除区域。
自动翻译的探测器在不同微阵列平台和生物允许研究人员比较结果通过简单的拖拽功能维恩图。这种无缝的翻译还允许研究人员快速识别实体列表,共享一个显著内容重叠。这种易于勘探数据允许快速发现药物治疗,疾病,或其他实验生物资料和相似的因素,因此,可以共享同样的潜在机制。
GeneSpring 11继续发展其强度在生物情境化通过扩展其网络分析工具的功能。提供的一套算法结合organism-specific通路相互作用数据库使研究人员能够产生一系列的网络类型和动态探索生化网络描绘他们感兴趣的实体之间的交互。
GeneSpring 11增加能力的研究人员使用网格生成网络作为输入。例如,研究人员可以使用“心力衰竭”作为输入网格和网络包含交互与心脏衰竭是自动生成的。研究人员可以确定他们的基因表达数据与这种疾病网络相交。
释放GeneSpring工作组11还增加了两个网络客户的企业级产品,与中央数据库存储multi-omics数据。数据浏览器提供了一个接口,用户可以搜索实验和样品存储在工作组的数据库使用可配置搜索字段。相关数据文件可以下载,并从GeneSpring可以发布静态图像。
Web客户端允许用户动态可视化并探索实验和结果存储在工作组中使用所有可用视图和情节GeneSpring通过一个网络接口。用多种方式来访问存储数据,工作组为科学家们提供了一个有效的方式协作和共享分析结果和知识。
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