安捷伦科技增加了新的生物信息学套件集成的生物学功能

安捷伦科技公司公布GeneSpring 12.0,大举扩张其流行的生物信息学软件设计,使一个新的水平的医学突破。新版本,GeneSpring用户现在可以分析下一代测序数据进行联合分析在通路级跨多个“组学”平台在一个熟悉的软件环境。

这些新功能扩展现有GeneSpring模块对转录组、遗传、代谢组学和蛋白质组学数据分析。

GeneSpring 12.0的发布,安捷伦继续兑现其强有力的承诺,帮助研究实现系统生物学的承诺通过提供先进的仪器和强大的软件工具,“Gustavo萨勒姆说,安捷伦科技公司副总裁和总经理,生物系统。“GeneSpring生物信息学软件套件使新一代的综合生物学研究复杂的分析、可视化和数据管理软件”。

GeneSpring 12.0的新的综合途径建筑师模块是提供给所有客户免费评估阶段,现在通过8月17日。

新版本包括一个门店模块为下一代测序。捷模块设计和测试使用安捷伦的SureSelect target-enrichment平台以及un-targeted下一代测序实验。捷不可或缺的一部分模块是QC经理,提供图形化的工具目标浓缩、基础质量、映射和对齐质量控制。DNA-SEQ GeneSpring挥动的工作流模块包括工具来识别和分析已知和新颖的变体,注释SNPs, SNP预测效果,检测结构变异。RNA-SEQ工作流支持mRNA分析绝对和相对空间,包括检测和微分表达式分析基因和拼接的变体。这包括小说基因外显子检测、基因融合分析和复杂的统计分析工具和途径。

安捷伦的新的生物信息学软件方便的经验几乎为零的生物学家在新一代测序的生物信息学数据管理与分析,指导他们通过向导驱动的工作流。组织,它提供了一个方便的方式分类,探索数据处理的生物信息学工具。GeneSpring 12.0也与安捷伦的免费eArray门户集成,使用户能够面临设计自定义实验通过一个易于使用的界面。

集成异构数据的组学技术是系统生物学研究的重要组成部分,其中包括测量大量的各种生物实体相同或密切相关的生物样本。GeneSpring通路建筑师模块旨在使研究人员能够进行联合pathway-level几乎任何生物实体的分析。这包括成绩单和拼接变异,影响基因面板从变异分析,代谢物和蛋白质。

GeneSpring通路建筑师模块使科学家能够查看和分析策划途径内容。这是通过利用WikiPathways,公开可用的资源用于建筑、注释和查询生物通路。跨多个公共和私有生物标识符映射注释数据库还支持通过集成BridgeDB,另一个公开可用的资源。主要数据从任何single-omic实验可以合并成一个multi-omic实验和使用共同确定统计学意义通路参与许多生理过程,如信号事件,疾病进展或毒性。

现在GeneSpring 12.0定制功能包括增强集成Jython和R编程语言。使用嵌入的脚本编辑器,生物信息学科学家可以编写,执行,并保存自己的算法和工作流GeneSpring 12.0编程框架。

安捷伦GeneSpring 12.0是与链科学情报合作,开发有限公司是由链Avadis平台,旨在使科学家能够简化和解决复杂生命科学挑战。