CHEMGENOME 2.0

ChemGenome是一个从头开始在原核基因组基因评价和预测模型基于物理化学特征的基码从分子动力学(MD)模拟计算。它使用物理化学属性构建一个三维向量来回答最基本的问题,“什么是基因?”。基因预测协议分为三个模块,形成一个自动化的管道。方法结合滤波器基于蛋白质序列的立体化学性质和出现的频率通过相应的氨基酸密码子在预测从175000年Swissprot蛋白质减少。方法验证在372年原核基因组与敏感性,特异性和相关系数平均超过356208个基因和同等数量的frame-shifted基因(non-genes)为97.5%,分别为97.20%和94.25%。