表达分析和黄金螺旋RNA-Seq采用克服障碍

黄金螺旋,inc .)和表达分析(EA)已经宣布他们的合作开发一个负担得起的和精简,基于云计算的分析解决方案,减少了障碍采用RNA序列。

RNA-Seq成为基因表达研究选择的工具,因为它可以促进现象的调查的传统微阵列,如小说成绩单和亚型,替代接头地点,和allele-specific表达式。此外,它提供了更大的范围和更高质量比微阵列基因数据。

下一代测序提供了前所未有的细节在序列水平上的生物数据,但在许多方面更大的洞察力可以提供迄今为止还没有意识到。

“主要原因RNA-Seq尚未广泛采用,“温德尔·琼斯,EA统计和生物信息学的副总裁,“是历史成本较高,已经明显下降,但也数量级高复杂性在生物信息学方面,数据存储和处理的新技术。在许多方面,RNA-Seq尚未访问更广泛的社区研究人员都熟悉他们已经使用多年的基础设施使用微阵列。我们的合作与黄金螺旋变化。”

黄金螺旋和表达分析建立了一个分析解决方案的生物过程将在基于服务的云计算环境中进行。这个产品将地址序列数据的障碍通过提供基于云计算的可扩展和集成桌面分析工具,负担得起和简化。

RNA-Seq EA /提供的服务黄金螺旋序列读取和对齐结果(主要和次要分析,分别)通过云存储和管理的地方,一个易于使用的界面。

当用户准备的“意义”这个数据(三级分析),黄金螺旋将提供RNA-Seq微分表达式工作流优化数据的SNP与变异套件(sv)与附加工作流进行DNA变异分析和遗传协会测试。

“EA和黄金螺旋非常互补功能,“克利斯朵夫兰伯特说,总裁兼首席执行官的黄金螺旋。“EA提供世界级的流程卓越自动化高通量测序和二级分析,我们带来cloud-competence和恒星高等分析软件,服务和支持。一起为我们共同的客户我们已经创建了一个端到端解决方案:从试验分析应用程序。”

黄金螺旋还将提供EA客户免费赠送,桌面基因组浏览器设计补充在云中提供的分析工作流。

“我们想要使基因组浏览更个性化和互动体验,”加布鲁迪说,黄金螺旋负责产品开发的副总裁。“谈到RNA-Seq数据,基因组浏览器将提供导航上下文数据,但在一个非常直观,用户友好的格式。”

”这种合作,我们结合我们的行业领先的核糖核酸测序技术和生物信息学的力量与黄金螺旋管道主数据和辅助数据分析的世界级的能力在基因组浏览和三级分析中,“史蒂夫麦克菲尔说,EA公司的首席执行官。”在一起,我们很兴奋将RNA-Seq更广泛的社区”。