多路12 x135k微阵列基因表达HD2现在可以从罗氏罗氏

十二个独立样本可以同时分析在一个幻灯片。有135000长寡核苷酸探针阵列,完整的转录组报道。类似于385 k和4 x72k罗氏微阵列,新的12 x135k阵列显示高特异性、高灵敏度和良好的重现性。有八个真核目录设计可用(人类,老鼠,老鼠,a芥,秀丽隐杆线虫,d .腹s .酵母和美国非洲酒),所有基于最新的全基因组的构建。为研究人员感兴趣研究生物体基因组新测序和注释,罗氏罗氏提供具有成本效益的定制设计的选项。

基因组学中心主任约翰·Colbourne印第安纳大学基因组学和生物信息学已经12 x135k HD2使用数组来研究种群的淡水microcrustacean水蚤应对环境压力。“我们首先验证基因和改善基因结构的当前列表模型使用罗氏平铺的表达式数组。实验结果更好的描绘基因组的转录区域的设计和指导12-plex一套全面的调查。”为每个数组12-plex容纳135000探针,Colbourne的团队能够设计三个探测每一个预测基因和一个探测器每转录区域。“在所有,40%的设计探针在未经地区居住。没有其他数组可以负担得起这种奢侈。在快速的时间,我们的转录分析实验检测的co-regulation识别基因和许多未知基因在大范围的条件下,同时提高基因组注释”。

灵活的定制设计和优良的品质的基因表达数据集12 x135k数组分开。多路传输格式提供了一种有效的方法在不影响数据质量。Selleri罗,康奈尔大学医学院的副教授,证实“罗氏12-plex基因表达微阵列的使用比其他平台优势和更准确的,因为它允许运行在同一个数组复制在同一个实验验证分析。“Selleri研究的发展贡献人类原癌基因的生物功能Pbx1, homeodomain蛋白最初确定为儿童期白血病的致癌基因的产物。在她的实验室,他们运用各种遗传方法之间的桥梁基因发现和基因功能。她赞赏的简单功能12 x135k阵列和数据的简单解释。”进行阵列杂交是相对简单的。分析的结果是用户友好的,并且不需要高度专业化的信息技能”,Selleri说。

研究社会容易认出罗氏罗氏微阵列技术的潜力。数组已经使用了许多应用,例如研究多个信号通路相关基因表达水平在组织和细胞。研究人员还利用系统的灵活性来识别因素参与组织分化和评估密切相关的物种差异基因表达模式。进一步的潜在应用包括癌症和干细胞研究,基因表达研究细胞分化、药物检测、环境研究、食品测试。

“12 x135k数组是一个功能强大的工具,实现高通量基因表达分析”,Gerd马斯河说,总裁/首席执行官罗氏罗氏。”结合罗氏定制设计选项和探针密度高,这些数组允许方便和准确的分析范围广泛的生物,从最简单的细菌复杂哺乳动物和植物。这些数组将加速功能基因组学研究和支持我们的目标是提供创新的解决方案更快和更准确的结果。”