罗氏罗氏的革命序列捕获技术现在在研究实验室使用

罗氏罗氏提供专门设计的序列捕获阵列研究员,连同必要的设备、试剂和耗材。现场客户研讨会也可供研究人员获得宝贵的实践经验的指导下认证序列捕获运动鞋。研究人员然后执行自己的捕获实验后的指示用户指南验证对于人类和小鼠,并执行快速测序丰富地区使用下一代技术如454年基因组测序仪FLX。
整个工作流程,从基因组DNA开始,丰富目标区域的DNA,测序结果大约需要两个星期。目标DNA的选择性浓缩使用专门设计的高密度寡核苷酸微阵列组成的385000调查,是一种非常有效的替代pcr方法,特别是在时间,成本,和可伸缩性。5 Mb的连续的或非连续的基因组序列可以捕捉到一个数组中。目前,罗氏序列捕获阵列和服务是唯一的商用技术研究人员进行大规模测序目标快速的周转时间。

在高通量测序解决方案实验室西雅图华盛顿大学的序列捕获385 k定制交付数组已经在充分利用——很好的成功。“我们发现罗氏序列捕获阵列和协议很容易使用,经常观察到成功捕获实验,”迈克尔·杜斯纳说,主任单位。他还赞赏的质量控制系统。“它不仅提供了健壮的设备有针对性的洗脱模板也是qPCR-based试验评价程度的浓缩。“除了序列捕获传递数组,罗氏还提供了验证设备和工具,包括一个名为洗脱站的新仪器,为了方便研究人员达到一致的和可再生的捕获效果。此外,执行这样的尖端研究的成本节约使用罗氏序列捕获阵列与以往技术相比是一个很大的优势。杜斯纳解释说,“罗氏罗氏的序列捕获技术提供了一个具有成本效益的替代PCR基因的富集目标促进大规模测序的发展项目和众多的下一代sequencing-based化验。”

序列捕获阵列的使用不仅解决DNA测序系统中的一个主要瓶颈,目标基因组区域的隔离,但也增强了下一代测序的优势。数组是一个完美的适合长读的454测序技术,从而使单体型和识别等变化的插入,删除和snp单碱基对。目前,DNA片段可以直接利用在454系统库测序过程作为输入准备。“罗氏罗氏序列捕捉系统彻底改变了可以测序基因组区域的利益,“拿撒勒琳说,副教授贝勒医学院人类基因组测序中心,休斯顿。“系统为科学界提供了一个宝贵的工具,基因序列的快速审讯,尤其是当结合下一代测序技术。我们已经成功地使用靶向基因捕获技术丰富和发现系统是用户友好的和具有成本效益,从而促进我们的重测序项目。”

罗氏罗氏目前开发协议,将允许直接添加454适配器序列捕获工作流,从而进一步简化工作流程,促进更快的周转时间。目的是为研究人员提供更完整的解决方案,有针对性的下一代测序——在自己的实验室里,自己的板凳上,在自己的时间表。