qPCR:大麻微生物检测的有力工具
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在大麻科学界，某些微生物大麻检测方法的适用性已经成为一个相当大的争论。
这个问题最近成为了头条新闻，马萨诸塞州的州议员因为拒绝标准化该州的微生物检测方法．尽管政府决定批准两家大麻检测实验室发放娱乐用大麻检测执照，但还是遭到了批评一个使用基于dna的定量聚合酶链式反应(qPCR)技术的测试设备，另一个使用传统文化方法(中医)．
不同的观点也导致了其他州对这些技术使用的规则发生了变化;加州的大麻管制局最近提出了一套新的检测法规，该法规支持使用基于菌株特异性pcr的方法，并且不包括对更通用的酵母和霉菌总数(TYMC)的要求，这是一种使用中药的质量控制测试。这一举动违背了政府的建议加州大麻产业协会质量控制委员会，他们认可这两种技术，但认为排除TYMC要求是不必要的对公众安全的威胁．
为了了解更多关于qPCR检测技术的知识，我们采访了Yvonne Helbert，一名高级研发科学家药物基因组学．药物基因组学是大麻遗传学研究的专家，并创建了第一个大麻特异性的经过验证的微生物安全测试平台，称为PathoSEEK，采用qPCR方法。
Alex Beadle (AB):是什么让qPCR成为对大麻基质如此强大的分析技术?
伊冯·赫尔伯特(Yvonne Helbert):大麻基质非常复杂。除了生活在植物表面的许多微生物外，还有内生菌，它们是生活在植物内部的细菌或真菌，不会对植物造成明显的疾病。由于大多数基于培养的技术依赖于在培养基中生长的活细胞进行检测，它们不像基于dna的方法那样裂解植物细胞来观察内源性病原体。
曲霉属真菌是已知的植物内生菌，四种曲霉属(黄曲霉，黑曲霉而且terreus)是已知的人类病原体。因此，必须对花样品进行裂解，以便准确地捕获内生菌。
AB: qPCR作为一种技术被广泛应用或认可的程度如何?
你怎么qPCR技术广泛应用于基因表达、基因分型、病原体检测、病毒定量、产前基因检测、血液筛查、肿瘤检测等领域。qPCR市场被认为是精确、灵敏、快速定量核酸序列的“金标准”。全球qPCR和数字PCR (dPCR)市场预计到2025年将达到63亿美元Grand View Research, Inc .的报告．
AB:在您看来，使用基于培养的电镀技术作为微生物分析的一种形式的主要缺陷是什么?
你怎么基于培养的电镀技术无法区分致病、有益和良性微生物，使其安全性指标较差。此外，如前所述，基于培养的电镀技术不能检测植物内生菌，这可能导致假阴性结果。AB:与传统的电镀方法相比，qPCR有什么优势?YH: qPCR比电镀更快——结果可以在几小时内得到，而不是几天。qPCR也比电镀更准确。qPCR检测方法积极地寻找一个微生物家族共享的特定DNA序列。如果DNA存在，qPCR将检测到它。这种积极的方法意味着我们可以设计物种特异性的分析，只针对致病物种，如曲霉菌和大肠杆菌。
文化电镀则要被动得多。你实际上是把细胞放在生长介质中，希望它足够有利，让它们生长，这样你就可以数它们了。问题是只有一小部分的微生物培养。如果在同一种培养基中有多种微生物，它们就会相互竞争。我们已经证明，培养后微生物种群的组成可能与植物上的实际组成完全不同。
AB:就药物基因组学公司正在做的工作而言，你还有什么想要强调的吗?
你怎么药用基因组学公司开发并验证了SenSATIVAx DNA提取试剂盒和PathoSEEK qPCR检测方法，专门用于大麻微生物检测。
这很重要，因为许多其他针对大麻的微生物检测解决方案都是从食品工业中提取出来的，据我们所知，这些解决方案还没有在大麻上得到验证。大麻是一种非常复杂的基质，有三种主要形式:干花、大麻提取物、浓缩物和食用物。
这种花富含脂质，非常粘稠。这提出了一个挑战，因为富脂基质不能用简单的水再现进行采样。脂质需要溶解在水中，以充分采样这种需要强大的裂解缓冲液的基质。虽然快速简单的水制剂对快速无人工提取很有吸引力，但它们无法完全采样花的微生物多样性。这种花还充满了毛状体、萜烯和大麻素，增加了评估微生物多样性的另一层困难。提取物和浓缩物的范围可以从醇基油到酊剂，到全植物提取物。可食用食品可以是任何东西。
我们的DNA提取试剂盒在设计时考虑到了所有这些基质。
MGC技术的另一个独特之处在于DNA提取试剂盒提取了微生物DNA和大麻DNA。大麻DNA随后被用作所有PathoSEEK检测分析的内部阳性对照。此内阳性对照信号表明DNA提取过程、qPCR检测设置和检测运行均成功。
这个问题最近成为了头条新闻，马萨诸塞州的州议员因为拒绝标准化该州的微生物检测方法．尽管政府决定批准两家大麻检测实验室发放娱乐用大麻检测执照，但还是遭到了批评一个使用基于dna的定量聚合酶链式反应(qPCR)技术的测试设备，另一个使用传统文化方法(中医)．
不同的观点也导致了其他州对这些技术使用的规则发生了变化;加州的大麻管制局最近提出了一套新的检测法规，该法规支持使用基于菌株特异性pcr的方法，并且不包括对更通用的酵母和霉菌总数(TYMC)的要求，这是一种使用中药的质量控制测试。这一举动违背了政府的建议加州大麻产业协会质量控制委员会，他们认可这两种技术，但认为排除TYMC要求是不必要的对公众安全的威胁．
为了了解更多关于qPCR检测技术的知识，我们采访了Yvonne Helbert，一名高级研发科学家药物基因组学．药物基因组学是大麻遗传学研究的专家，并创建了第一个大麻特异性的经过验证的微生物安全测试平台，称为PathoSEEK，采用qPCR方法。
Alex Beadle (AB):是什么让qPCR成为对大麻基质如此强大的分析技术?
伊冯·赫尔伯特(Yvonne Helbert):大麻基质非常复杂。除了生活在植物表面的许多微生物外，还有内生菌，它们是生活在植物内部的细菌或真菌，不会对植物造成明显的疾病。由于大多数基于培养的技术依赖于在培养基中生长的活细胞进行检测，它们不像基于dna的方法那样裂解植物细胞来观察内源性病原体。
曲霉属真菌是已知的植物内生菌，四种曲霉属(黄曲霉，黑曲霉而且terreus)是已知的人类病原体。因此，必须对花样品进行裂解，以便准确地捕获内生菌。
AB: qPCR作为一种技术被广泛应用或认可的程度如何?
你怎么qPCR技术广泛应用于基因表达、基因分型、病原体检测、病毒定量、产前基因检测、血液筛查、肿瘤检测等领域。qPCR市场被认为是精确、灵敏、快速定量核酸序列的“金标准”。全球qPCR和数字PCR (dPCR)市场预计到2025年将达到63亿美元Grand View Research, Inc .的报告．
AB:在您看来，使用基于培养的电镀技术作为微生物分析的一种形式的主要缺陷是什么?
你怎么基于培养的电镀技术无法区分致病、有益和良性微生物，使其安全性指标较差。此外，如前所述，基于培养的电镀技术不能检测植物内生菌，这可能导致假阴性结果。AB:与传统的电镀方法相比，qPCR有什么优势?YH: qPCR比电镀更快——结果可以在几小时内得到，而不是几天。qPCR也比电镀更准确。qPCR检测方法积极地寻找一个微生物家族共享的特定DNA序列。如果DNA存在，qPCR将检测到它。这种积极的方法意味着我们可以设计物种特异性的分析，只针对致病物种，如曲霉菌和大肠杆菌。
文化电镀则要被动得多。你实际上是把细胞放在生长介质中，希望它足够有利，让它们生长，这样你就可以数它们了。问题是只有一小部分的微生物培养。如果在同一种培养基中有多种微生物，它们就会相互竞争。我们已经证明，培养后微生物种群的组成可能与植物上的实际组成完全不同。
AB:就药物基因组学公司正在做的工作而言，你还有什么想要强调的吗?
你怎么药用基因组学公司开发并验证了SenSATIVAx DNA提取试剂盒和PathoSEEK qPCR检测方法，专门用于大麻微生物检测。
这很重要，因为许多其他针对大麻的微生物检测解决方案都是从食品工业中提取出来的，据我们所知，这些解决方案还没有在大麻上得到验证。大麻是一种非常复杂的基质，有三种主要形式:干花、大麻提取物、浓缩物和食用物。
这种花富含脂质，非常粘稠。这提出了一个挑战，因为富脂基质不能用简单的水再现进行采样。脂质需要溶解在水中，以充分采样这种需要强大的裂解缓冲液的基质。虽然快速简单的水制剂对快速无人工提取很有吸引力，但它们无法完全采样花的微生物多样性。这种花还充满了毛状体、萜烯和大麻素，增加了评估微生物多样性的另一层困难。提取物和浓缩物的范围可以从醇基油到酊剂，到全植物提取物。可食用食品可以是任何东西。
我们的DNA提取试剂盒在设计时考虑到了所有这些基质。
MGC技术的另一个独特之处在于DNA提取试剂盒提取了微生物DNA和大麻DNA。大麻DNA随后被用作所有PathoSEEK检测分析的内部阳性对照。此内阳性对照信号表明DNA提取过程、qPCR检测设置和检测运行均成功。
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