结合下一代蛋白质组学和下一代测序

上周AB SCIEX和Illumina公司宣布OneOmics™项目独家合作,汇集片™的下一代蛋白质组学(NGP)和下一代测序(上天)工具在云计算环境中。

相信这次快速,安全,和简化分析的复杂multi-omics数据集,将有助于推进生物标志物的发现和援助研究疾病,如癌症、糖尿病、阿尔茨海默氏症和心脏病。

了解更多关于这个项目和它所提供的福利研究人员,我们采访了马克Cafazzo MBA,高级市场经理,在AB SCIEX蛋白质组学

阿瑟:你能告诉我更多关于的目标OneOmicsTM项目吗?

马克Cafazzo (MC):我们相信,今天的生物标志物的发现将导致明天的个性化医学,然而仍有需要克服的挑战。

组学数据将来自多种技术在多种格式。数据集将大代表广泛的生物条件我们需要开发的解决方案将允许复杂的生物学结果的比较和可视化的多个组学技术。为此,我们需要一个综合的工作空间,更大的项目可以完成。一个环境中,数据处理和可视化和共享相比,在一个安全的用户友好的工作区:OneOmics云中的数据环境。把OneOmics项目。

阿瑟:Illumina公司的合作是怎么来的?

主持人:有一个片把定量蛋白质组学技术在更大的规模。能够准确地量化几千蛋白质在数以百计的样本,研究人员现在可以进行有意义的生物的结论。下一个合乎逻辑的步骤就是将这些结论与其他组学的结果,如基因组学和转录组。Illumina公司和AB SCIEX单视觉和补充完全贴合在一起的解决方案。两家公司也有一个大型的网络内部和外部的组学专家可以帮助实现这一愿景,很快。不仅我们发射片BaseSpace蛋白质组学的应用;但是我们的合作伙伴和合作者在Advaita,耶鲁大学和系统生物学研究所推出的免费应用程序扩展工作流和代表的第一步比较RNA-Seq数据和蛋白质组学数据。

阿瑟:我们已经看到,方法有6片云工具包将有助于研究人员研究下一代蛋白质组学,你能告诉我更多关于这些?

司仪:蛋白质组学云狭长工具包地址许多客户痛点,从50 x更快的处理时间的大型复杂的数据集,在几分钟内完成而不是几天,确保你总是有你的应用程序的最新版本,并减少与生物信息学相关的开销,IT资源和硬件。最重要的是它允许协作、跨领域和全球研究社区同时帮助个人核心实验室支持更多机构实验室,更快。最重要的改进,利用云计算的力量是生物学家现在可以可视化数据的方式有关,不再需要特殊的帮助,只需使用浏览器蛋白表达和走。

阿瑟:目前有4片BaseSpace上测试应用程序,这些用户如何注册?

主持人:用户只需登陆basespace.illumina.com,注册一个免费账户。从菜单中选择蛋白质组学发现片云应用程序。

马克Cafazzo阿什利董事会,管理编辑技术网络。188金宝搏备用