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现代微阵列技术的创新与多功能性

cDNA芯片的结果,反映了两个不同组织之间的基因表达差异。
来源:美国国家癌症研究所

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微阵列自从首次被提及以来,一直是生物医学和临床研究战略的关键组成部分1995年的研究.这项技术最初用于测量基因表达或转录,后来被扩展和改进,用于分析许多其他生物化学样本类型,如蛋白质或小分子。


微阵列技术的创新进步意味着现代微阵列仍然是各种高通量需求的快速可靠解决方案,支持生物标志物和药物发现等领域。


为了了解更多关于现代微阵列技术提供的机会,188金宝搏备用采访了伊恩·麦克威廉博士, CEOArrayjet.McWilliam还讨论了非接触式微阵列打印技术以及这些工具可以为高通量筛选提供的优势。


Sarah Whelan (SW):你能简单解释一下微阵列是什么以及它们的用途吗?


伊恩·麦克威廉(IM):微阵列通常是一个玻璃载片,上面有数千个生物或化学探针固定在一个微型2D网格中。然后在微阵列上培养感兴趣的样品,并用荧光标记检测特定的相互作用。最常见的是,微阵列用于高通量筛选,药物发现中的命中检测和多重诊断。它们通常被称为实验室测试用的微芯片。


斯蒂芬尼:早期的微阵列主要用于DNA分析,用这种技术还能打印和分析什么?


即时通讯:现代微阵列可以打印蛋白质、抗体、抗原、聚糖、细胞裂解物和小分子。这使得它们除了分析基因表达的“原始”目的外,还适用于广泛的应用,包括蛋白质组学、抗体表征、生物标志物发现、即时诊断、靶点识别和药物发现。


SW:喷墨微阵列打印机的主要特点是什么?它们是如何工作的?


即时通讯:微阵列需要数千个样品的微小体积才能精确而一致地分配。Arrayjet的microarrayers使用工业级喷墨打印头,专为高质量图形设计,已采用专利工程打印生化样品。


样品被装入打印头的底座与一个专门的吸气器。吸气器分离,打印头在表面滑动,以用户定义的模式沉积样品,无需停止或接触。整个打印空间包含在hepa过滤环境中,严格控制湿度和温度。打印头安装的高速摄像头跟踪打印,并将图像输入我们的人工智能驱动软件,实时保证打印质量。


总之,这意味着喷墨微阵列打印具有最高的精度,可靠性和速度。


SW:这种非接触式阵列打印技术与其他打印技术相比有什么优势?


即时通讯:微阵列最初被发明时,是用大头针将样品直接印在表面上。最近,非接触式微阵列是首选因为它们更快,更可靠,具有减少交叉污染和更好的斑点形态。


许多非接触式点胶仪器使用类似于抽液玻璃吸管的玻璃尖端,但这些尖端难以校准,可能限制布局选项,容易损坏,更换成本高达数千美元。相比之下,喷墨打印头非常坚固,只需按一下按钮就可以切换微阵列布局。


对于筛选操作,吞吐量是至关重要的喷墨微阵列的压倒性优势是速度.它们还具有较高的重现性,很大的灵活性和适应简单的步行操作。更新、更快的喷墨方法意味着微阵列是一种具有成本效益的选择,用于筛选以前可能没有考虑过的应用。


SW:你能多介绍一下你们的ArrayPlex现场微阵列平台吗?这种技术的应用是什么,它提供了什么额外的好处?


即时通讯:ArrayPlex™是我们的专利,基于阵列的快速组合文库筛选技术.它包括将一组捕获样本打印并固定到一组幻灯片上,然后在上面打印第二个测试库。吞吐量是惊人的-在每周的实验周期中可以产生超过200万个独特的交互。我们最常使用这种方法进行免疫治疗抗体命中检测,通过筛选人类组织样本对抗杂交瘤抗体库,但该技术与其他蛋白质、核酸和小分子兼容。


斯蒂芬尼:你能给我们举几个最近成功使用喷墨微阵列技术的例子吗?


即时通讯:目前一个特别令人兴奋的领域是小分子和生物制剂的药物筛选。寻找新平台的药物猎人已经转向微阵列作为传统的高通量筛选方法和质谱方法的替代品。


对于小分子,Arrayjet采用了麻省理工学院、国家癌症研究所和斯克里普斯研究小组首创的工艺,并通过简化的固定和检测协议使其易于使用首个小分子微阵列商业平台.数万数以千计的类似药物的小分子化合物可以被打印在一张幻灯片上并与感兴趣的RNA或蛋白质一起孵育,以寻找新的配体-靶点。


在其他地方,对于生物标志物的发现,我们最近发表了一篇应用说明,以支持从停止接触引脚技术转移到现代喷墨微阵列的反相蛋白质阵列-显著提高速度,精度,密度和斑点形态。


其他的例子包括蛋白肽阵列用于分析COVID-19的体液反应,而我们的与KEMRI-Wellcome Trust合作,“小型化”他们的ELISA,用于高效的疟疾疫苗靶点鉴定提高了99%的生产率。


SW:这些更现代、更先进的微阵列与其他高通量技术相比如何?它们能否帮助解决对高通量筛查日益增长的需求?


即时通讯:有很多高通量筛查方法包括基于细胞的分析,与珠子的多路复用,RNA测序和质谱分析。微阵列是一种成熟的、经过充分验证的技术,能够补充和增强这些方法。


不仅仅是DNA,微阵列可以筛选广泛的生化样本,而喷墨微阵列可以简单、可靠和快速地做到这一点。作为吞吐量的一个例子,Arrayjet Mercury微阵列:

  • 每秒存储超过700个特征
  • 单批次可装载超过18000个样品
  • 在单个批次中打印多达1,000张幻灯片
  • 1000张幻灯片中每个样品只需要0.5µl
  • 每张显微镜载玻片能容纳10万个特征吗


使用喷墨技术,Arrayjet的微阵列仪器而且服务设备齐全,可满足行业对高性价比、高质量和高通量筛选的需求。


伊恩·麦克威廉博士接受了科技网络科学作家莎拉·惠兰的采访。188金宝搏备用

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莎拉·惠兰
莎拉·惠兰
科学作家
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