FlyEM / Hemibrain

大脑的hemibrain体包括许多科学家们最感兴趣的研究领域,如电路控制学习,记忆,和关键行为。

的hemibrain连接体是有史以来最大的synaptic-level体重建。它涵盖了中央飞大脑的很大一部分,包括蘑菇体和中央复杂电路联想学习和飞行导航的关键。时钟神经元迂回中体积也可以提供见解机制睡眠。此外,鉴于可用光学显微镜图像数据和先前的部分连接体视叶重建,我们还发现了大多数视叶神经元进入百磅的大脑区域使下游视觉处理的分析。

这个连接体重建包含大约25000个神经元,可以组合成成千上万的不同类型的细胞生成一些大脑区域。这个连接体成像技术的进步,要求分割(在Google——组),和校对和分析软件。

开始

• 阅读概述篇描述hemibrain和底层技术。
• Hemibrain是下许可CC-BY。
• 探索使用neuPrint数据集:一个分析探索连接体的生态系统。
  • 见下面的教程视频以及更详细的文档。
• 视图中的数据neuroglancer
• 看到相关的资源密集型的编程访问下面的连接体数据。
• 如果你有问题,问题,和评论
  • 文章相关软件github页面或neuPrint用户组。
  • 连接体重建通过neuPrint neuroglancer界面反馈是可能的。我们的目标是解决重要问题与我们团队的校对。看到我们的教学视频。

FlyEM团队开发了免费工具通过连接体数据,包括NeuPrint。使用这个工具,科学家可以搜索特定的细胞类型和识别特定地区或神经元之间的连接通道。

资源和相关技术

hemibrain电路的视频

神经科学家已经使用的连接体数据了解机械的飞行行为的基础。这里显示的电路是飞中央复杂,控制一个区域导航。

果蝇hemibrain图像,研究人员精确地把苍蝇的大脑切成较厚板用热刀。然后每个板成像利用聚焦离子束和扫描电子显微镜(FIB-SEM)与纳米各向同性分辨率生成数据。之后,图像不同部分的被仔细缝合在一起。目标:创建一个图像体积尽可能小畸变沿边界,使跟踪通过大脑神经元的路径。

研究人员已经确定了超过4000种不同类型的神经元在果蝇hemibrain。下面是其中的一些。

完成所需的hemibrain体优化过程的每一个部分,从显微镜成像大脑神经元算法,自动追踪数据集。本视频概述的努力。