“跳跃基因”可能导致罕见的儿童发育障碍

在一项分析了28000多人外显子的研究中，研究人员发现，所谓的“跳跃基因”似乎是一些儿童罕见发育障碍的背后原因。研究结果发表在自然通讯．

“跳跃基因”

DNA并不总是停留在同一个地方;一些片段具有冒险的特点，并习惯于在基因组中移动。这种可移动的片段被称为转座子或“跳跃基因”，在我们的基因组中存在数以万计的拷贝。有两个类在这些遗传因素中;只有一种逆转录转座子在人体内是活跃的。¹

取决于它们的目的地，转座子可以产生重大影响。插入转座子可能导致基因失活、基因表达水平改变，甚至染色体重复。²因此，转座子已涉及多种疾病，包括血友病和癌症。¹

因此，第一作者尤金·加德纳他和同事们开始调查转座子是否也在发育障碍中发挥作用。

“破译发育障碍”项目

破译发育障碍(DDD)项目于2010年启动，旨在通过收集DNA和临床信息，并使用最新的微阵列和测序方法进行分析，为患有以前未诊断的严重发育障碍的儿童提供遗传诊断。正是在这个项目的范围内，对转座子的作用进行了研究。

Gardner和同事们分析了患有未确诊发育障碍的儿童及其父母的外显子组或编码序列。^3.他们正在寻找外显子组中由转座子插入引起的变异——他们找到了。

“在我们的研究中，我们一直在努力识别跳入基因的副本，这些基因已被确定为发育障碍的可能原因。所以，就像你DNA密码碱基的一个变化会导致罕见的发育障碍一样，转座子也会导致罕见的发育障碍，”加德纳说。

通过识别转座子插入的痕迹，作者能够为三名儿童提供遗传诊断。尽管这种可能性一直存在，但还是让他们大吃一惊。

对此，Gardner解释说:“新的转座子插入非常罕见，当我们开始这项研究时，我们在我们的10,000名招募患者中设定了0-10个诊断的粗略预期。虽然我们最终得到了正确的范围，但如果突变率被证明更低一些，我们可能就无法做出任何诊断。”

“虽然这是一个基本的科学问题，但我们的最终目标是帮助我们的患者，即使做出一点小小的贡献，感觉也很棒。”

接下来是什么?

这些发现是DDD项目已经做出的几个发现之一。加德纳说:“对我来说，我认为最大的突破是这个项目的规模——DDD已经帮助了英国和爱尔兰各地成千上万的家庭了解他们或他们孩子的障碍的根本原因。”“这得益于临床医生和研究人员之间强有力的合作伙伴关系，使双方能够更好地了解发育障碍的潜在遗传原因。”

对于转座子研究，加德纳希望这些发现会产生积极的影响:“目前，这个结果将提供一些关于他们孩子发育障碍原因的结束感，并允许父母/护理人员根据我们报告的基因寻找其他可能患有相关疾病的家庭。此外，我们的研究结果与遗传咨询相结合，可以帮助父母在未来做出生育决定。”

“对于未来，我希望这能让临床医生相信，至少在未确诊的病例中，研究转座子等不太常见的遗传变异类型是值得的，这样可以尽可能地为每个孩子做出诊断。”

尤金·加德纳博士接受了技术网络编辑助理霍利·拉奇的采访。188金宝搏备用

参考文献

1. 汉克斯和Kazazian Jr.(2016)逆转录转座子插入在人类疾病中的作用。移动DNA．DOI: https://doi.org/10.1186/s13100 - 016 - 0065 - 9
2. Muñoz-López和García-Pérez (2010) DNA转座子:在基因组学的性质和应用。目前基因组学．DOI: https://doi.org/10.2174/138920210790886871
3. Gardner等人(2019)逆转录转位对发育障碍的贡献。自然通讯．DOI: https://doi.org/10.1038/s41467 - 019 - 12520 - y