Whole-Exome测序有助于识别基因突变与某些神经系统疾病有关
使用外显子组测序能够识别潜在的改善患者的基因突变定义缺陷影响生化反应多个线粒体呼吸链复合物(酶参与基本能源生产),在7月2日出版的一项研究显示《美国医学协会杂志》上。
线粒体呼吸链的缺陷已成为最常见的导致儿童和成人neurometabolic疾病,据估计患病率的l 5000活产。临床上这些疾病可以出现在任何时间的生活,经常出现与神经损伤,并导致长期残疾和早亡。线粒体疾病的诊断仍然是具有挑战性的,根据这篇文章的背景信息。问题引起的线粒体疾病的例子包括癫痫的类型;线粒体脑病;乳酸酸中毒;和一个综合征,包括类似中风发作。
Robert w .泰勒博士F.R.C.Path。纽卡斯尔大学的纽卡斯尔,英国,和他的同事们研究了whole-exome测序的方法是否可以帮助定义线粒体疾病的分子基础。Whole-exome测序实验室是一个复杂的过程,决定了整个独特的有机体的外显子组序列(外显子的集合,相对较小的全基因组和控制指令的长度为身体建立蛋白质)。
这项研究包括53例,称为2国家中心在英国和德国在2005年至2012年之间,生化证据的多个呼吸链复杂的缺陷。绝大多数(51/53[96%])的病人提出在儿童时期(< 15岁),大多数(66%)出现症状在生命的第一年。最常见的临床表现是肌肉无力、中央神经系统疾病,心肌病,肝功能异常;这些异常的组合出现在大多数情况下。
whole-exome测序后,假定的因果变量被确定在28个病人(53%)和可能的因果变量被确定在4 (8%)。这些占32名患者(60%)和涉及18个不同的基因。区分临床特征包括耳聋和肾脏参与与一个基因有关,并与两个基因心肌病。20著名的心脏病患者,致病突变中检测出80%,肝病患者的检出率低得多(33%)。不可能自信地识别潜在的遗传基础在21个病人(40%)。
“pre-exome时代,系统的生化特征患者53多个呼吸链复杂缺陷导致检测潜在的遗传基础的病人只有1。本文提供的工作证明whole-exome测序的影响在这种背景下,已定义的遗传病因在32 53名患者(60%)证实了生化缺陷…,”作者写道。“我们的发现与大规模使用传统候选基因分析和下一代测序方法,这两种诊断产量较低(10 percent-13百分比)和定义没有发现新的潜在的致病基因。”
“额外的研究需要确定这种方法的实用程序与传统的诊断方法相比在独立的患者群体,”研究人员总结道。
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出版
Robert w .泰勒·派尔海伦格里芬,艾玛·l·布莱克,詹妮弗·达夫Langping他,塔尼亚Smertenko,夏洛特·l·阿尔斯通,薇薇恩·c·Neeve安德鲁最好,约翰·w·Yarham Janbernd柯式,Ulrike Schara, Beril Talim, Haluk Topaloglu, Ivo气压Elke Holinski-Feder,安吉拉•Abicht Birgit Czermin,斯蒂芬妮Kleinle,安德鲁·a·m·莫里斯恩典瓦萨罗Grainne s戈尔曼Venkateswaran拉梅什,道格拉斯·m·特恩布尔Mauro Santibanez-Koref,丽塔霍,帕特里克·f·罗伯特·麦克法兰Chinnery。使用Whole-Exome测序以确定多个线粒体呼吸链的遗传基础复杂的缺陷。《美国医学会杂志》,2014年7月2日发表。doi: 10.1001 / jama.2014.7184
