MALDI-HDMSE:一种新型的“数据独立”采集方法，用于增强2d凝胶胰蛋白酶肽消化的分析

肽质量指纹(PMF)是一种无偏倚的蛋白质识别技术，由于依赖于蛋白水解肽的m/z测量，它为识别目的提供有限的序列信息。

一种常用的替代技术是通过使用质谱仪的第一个分析器通过顺序选择将胰蛋白酶肽片段化来进行MS/MS测序实验。这种MS/MS方法有以下局限性:

■只有最强烈的多肽是碎片化的
■用户必须选择肽片段
■信息是有限的，因为如果样品耗尽，多肽可能会丢失
■样本被丢弃后，从样本中重新获得知识是不可行的
■可能比单独使用PMF更耗时

本应用笔记提出了一种新的数据获取方法，称为HDMSE (High Definition MSE)。该方法保持了PMF的独立性，但通过以简单、通用的方式提供分子和MS/MS样肽序列信息扩展了其实用性。

http://www.waters.com/waters/library.htm?cid=134612511&lid=134663780&xcid=x5307