解决RNA研究的挑战

RNA-based疗法包括不断扩大的信使rna,小分子核糖核酸,小干扰rna,反义寡核苷酸和寡核苷酸适配子。RNA-based疗法可以针对不同细胞分子,包括那些被认为是无药可治””——通路或分子不服从目标由传统药物。

信使核糖核酸(mRNA)疫苗用于预防COVID-19可能是最广泛认可RNA-based干预,但是其他RNA治疗已经被批准用于治疗肌肉萎缩症,黄斑变性和其他罕见的疾病,目前更多的临床试验。

188金宝搏备用说话的乐趣了吗伊莉莎小博士高级经理Azenta生命科学了解研究发展中面临的主要挑战RNA-based疗法和如何解决这些挑战。

凯蒂布莱顿(KB):RNA技术目前是如何被用于治疗的发展吗?在这一领域新兴的发展趋势是什么?

伊莉莎小(ES):使用疫苗在发展中解决COVID-19后,一个新的兴趣RNA技术已经出现在推进治疗疾病和癌症等疾病,囊性纤维化,淀粉样变和糖尿病等。RNA-based治疗目标疾病不能由其他常规药物治疗组和一些临床研究进行了各种疗法治疗一系列的不可治愈的疾病。

RNA-based疗法修改基因表达或引入新的基因靶细胞。它们可以被几十个核苷酸长度,如反义寡核苷酸、小型干扰RNA和小分子核糖核酸——或者成千上万的基地,在信使核糖核酸(mRNA)。小rna主要是用来沉默基因表达或调节拼接。更大的信使rna治疗可以替代有缺陷的蛋白质在细胞中,产生抗原疫苗接种或编辑通过CRISPR基因组技术。

RNA治疗有两个主要优势传统药品;首先,最无药可治的治疗目标是由小分子或抗体,这需要一个有利的蛋白质结合位点。RNA治疗却没有这样的限制,因为它们使用细胞的遗传机制变化的影响。其次,RNA治疗可以快速设计和制造。RNA合成技术已经很成熟,使任何序列的快速和具有成本效益的生产。

KB:当使用RNA研究人员面临的典型挑战?

ES:信使rna治疗,常见问题包括稳定性、转换效率和最终产品的纯度。一个信使rna分子本质上是不稳定的,内部和外部的细胞。结构元素,比如5 '帽、保利(a)的尾巴和翻译区域——提高翻译效率和稳定的成绩单。

研究人员可以在质量面临严重的局限性,可伸缩性或信使rna的速度生产过程不够优化。合成信使rna通常是由在体外转录,这需要一个DNA模板,通常是一种人工合成基因的产物。一旦信使rna产生质量控制是至关重要的,验证序列是准确和完整的成绩单是完好无损。否则,下游实验可能收益差或不一致的结果。

KB: Azenta的经验与RNA技术如何解决这些研究挑战?

ES:在过去的二十年里,Azenta生命科学支持科学界以其强大的功能核酸测序和合成。了解RNA治疗的进步提供的巨大机会,我们继续投资进一步发展这方面的专业知识应用到研究人员提供一个端到端流程无缝结合基因合成和在体外转录。研究人员仅仅提供一个核苷酸序列作为输入,生成高质量的mRNA的产品准备研究快速周转使用。我们的过程有效地增加了5 '帽和聚(a)尾成绩单去增加它的稳定性和功能。

严格的质量控制协议测量精度在整个工作流程,以确保最终产品的忠诚和正直的每一步的过程。使用的DNA模板的准确性在体外转录是完全由Sanger测序验证。信使rna产品的纯度和大小由紫外光谱分析,凝胶电泳和生物分析仪。此外,研究人员可以使用我们新一代测序(上天)功能读长篇连续的序列的信使rna分子。这种方法捕获保利(A)的尾巴并使您能够测量尾长度的分布。

KB:你能详细说明如何Azenta的长篇RNA-sequencing解决聚(A)反面?为什么这是重要的在设计RNA治疗?

ES:现有NGS-based方法评估mRNA分子主要的权衡。标准同种型测序(Iso-Seq) PacBio®平台上可以阅读个人成绩单的端到端,但聚(A)的尾巴在很大程度上是测序之前删除。化验的Illumina公司®短内容平台测量聚腺苷酸化长度的分布;然而,数据缺乏的背景下,其余的成绩单。

为了解决这些缺点,Azenta生命科学图书馆开发协议准备PacBio测序,保留了聚(a)的尾巴,使完整的RNA序列(RNA-Seq)。你可以看到什么RNA分子存在于样本及其频率。混合种群,包括截断产品具有单核苷酸决议。因为短聚(A)反面可以破坏mRNA在活的有机体内,彻底的描述一个信使rna的产品在实验之前,强烈建议使用。全身RNA-Seq提供了一个有效的质量控制和高通量的解决方案的疗法。

KB: Azenta什么福利的RNA技术使研究人员寻求进一步治疗的发现?

ES:RNA治疗的兴趣激增,尤其是在mRNA的高调成功COVID疫苗。十几个RNA-based疗法已经得到FDA的批准。大约30目前正在临床试验和更多的早期发展。这是成为一个竞争非常激烈的市场。研究者奖速度和可靠性,需要一个合作伙伴分享相同的职业道德。这些共享的优先级使Azenta无缝沟通和研究进展,操作作为一个有凝聚力的研究小组在世界任何地方。

通过与Azenta合作,他们可以访问工具来开发RNA治疗更快更好。基因组学服务信使RNA合成和全身RNA-Seq已经特地为科学家研究RNA治疗。他们帮助提高再现性,减少故障排除和释放时间为关键的实验。

KB:挑战仍在开发RNA治疗什么?Azenta设想如何克服这些挑战在未来?

ES:药物的稳定性、交付和免疫原性RNA-based仍然可以改善。未来几年可能会带来重大的创新,使这些疗法更有效和更好的目标。Azenta,我们兴奋的增长和进步的RNA治疗到目前为止,期待看到这个领域的成熟。我们将继续监控的最新发展和构建解决方案,帮助客户将RNA治疗市场更快。

伊莉莎小博士是凯蒂·布莱顿,科学技术网络文案。188金宝搏备用