减轻NGS库编制负担

新一代测序(NGS)无疑彻底改变了基因组学领域，由于近年来的技术进步，全球各地的实验室现在正在将NGS应用于各种各样的应用。然而，文库样本制备仍然是一个关键瓶颈，研究人员现在正在寻求采用自动化解决方案来缓解这一痛点，简化基因组学工作流程。

188金宝搏备用最近我和保罗·洛马克斯他是SPT Labtech的产品经理，了解从NGS中受益的领域并了解更多信息萤火虫^®该公司用于NGS库制备的新型液体处理平台。

Laura Lansdowne (LL): NGS已经成为许多研究领域不可或缺的技术，你能强调一下从这种方法中受益最多的一些领域吗?

保罗·洛马克斯(PL):NGS是一种迅速传播到许多不同研究领域的技术，如基因检测、个性化医疗、作物科学等等。也许第一个想到的领域是NGS在传染病监测中的应用。这显然已经成为全球识别和调查SARS-CoV-2变种的关键工具。我们都知道，自大流行开始以来，实验室处理的检测样本数量激增。但其他领域的需求也在不断增长。

个性化治疗例如，现在已经成为现实，特别是在肿瘤学领域。NGS支持基因组分析，对新药进行基因组测试，以确定它们是否适合特定的患者。目前也有许多新的研究成果即将取得成果，例如生物标志物驱动的临床开发正变得越来越主流。测序在罕见和可疑遗传疾病的诊断中起着至关重要的作用。

展望未来，用于药物发现的多组学研究的增长看起来非常有前景，研究人员将超越基因组，捕捉转录组、蛋白质组和代谢组的数据。这是令人兴奋的，新突破的速度正在增加。测序的速度一直在加快。实验室现在可以在一天内对人类基因组进行测序。而且这个过程也变得越来越便宜:如果现在还没有的话，我们很快就会达到100美元的基因组里程碑。

今天李华学了两个常话，一个是SPT Labtech的行业报告。开创基因组学液体处理的新时代，讨论了基因组学液体处理的未来，并提供了NGS客户关于他们的图书馆准备经验的见解。你能否介绍一下报告中讨论的一些要点?

PL:我们的报告涵盖了我们在基因组学实验室中看到的几个最近的液体处理趋势。许多人现在都在使用自动化解决方案来加速他们的NGS库的准备工作。该报告的一个关键收获是自动化大大提高了效率。自动化的NGS应用正在推动可靠性、准确性和吞吐量方面的巨大改进。实验室现在可以使用带有多种试剂的96孔和384孔板轻松地设置复杂的实验。由于智能和可访问的自动化，他们可以在降低成本的同时做到这一点。成本因素在加快更广泛的研究产出方面发挥着重要作用。一个紧凑的，一体化的解决方案，就像我们的萤火虫为实验室提供了具有成本效益和可访问的选项，以迈出NGS自动化的第一步或增强其现有的工作流程。多功能技术比单任务仪器占地面积更小，在该领域提供了许多好处。

在报告中，我们还阐述了为什么在现代基因组实验室中，自动化正在迅速普及。你不再需要外部自动化专家——我们看到实验室在开发和运行新协议时必须依赖仪器供应商的明确转变。当涉及到授权所有实验室人员时，易于使用的软件显然是关键。因为，这是最终的目标:实验室希望充分利用他们的高技能人员，确保他们的科学家可以花更多的时间分析结果和设计可靠的实验，而不是把宝贵的时间花在重复的手工工作流程或管理大型复杂的设备上，这些设备不能给他们提供所需的多功能性和灵活性。

在NGS图书馆的准备过程中，你认为研究人员面临的主要挑战是什么?萤火虫是如何帮助缓解这些问题的?

PL:在NGS和PCR协议中有许多步骤，因此在简化工作流程、减少试剂体积和限制尖端消耗方面具有巨大潜力。firefly将0.5 μ L至125 μ L体积范围内的高精度移液与非接触点胶相结合。这意味着你可以转移样品，运行珠清理，并做你的混合与萤火虫的分配头，同时管理所有其他协议步骤与萤火虫的分配头。与此同时，您还集成了孵化和摇动技术，以及一个板夹持器，以在萤火虫的甲板和加热器/冷却器板之间移动实验室。

基因组学的工作流程需要可靠和准确的移液和分配具有挑战性的液体，如酶试剂和珠子——通常是非常小的量。因此，小型化是一个关键的挑战，特别是如果你分配小体积粘性试剂。在这方面，firefly是一个真正的游戏规则改变者，它支持200 nL的非接触式分配。

图片来源:SPT Labtech

回到我之前所说的，功能强大，用户友好的软件几乎和液体处理平台本身一样重要。如果你考虑到今天研究人员面临的挑战——实验室面临着真实而直接的扩大规模的需求——液体处理软件需要让研究人员直观地使用。您不希望与复杂的编程步骤作斗争。因此，我们非常自豪和自信，firefly的软件将在未来几年树立一个新的行业标准。各级实验室用户可以通过简单的拖放在PC上远程构建协议。该软件具有“推定智能”，因为它预测了许多标准和常见的假设。它也是完全适用于应用程序的，具有预先验证的库准备套件协议，例如NEBNext Ultra II和Illumina DNA Prep.高级用户可以选择微调扩展功能。然后，实验室里的每个人都可以通过内置的平板电脑轻松访问这些协议。

我提到的另一个重大挑战是现代基因组实验室的空间限制。Firefly紧凑、一体化的设计为您提供了非常小的占地面积，特别是考虑到您所获得的所有功能。由于其集成的工作流程，您不需要占用额外的工作台空间使用单任务仪器。firefly为您腾出空间，并为实验室领导者提供他们正在寻找的投资回报率-生产力和仪器正常运行时间。

今天李华学了两个新词:firefly的对等云网络是同类产品中的第一款，它是如何鼓励合作和创新的?

PL:是的,当然。我们很自豪能够率先与firefly进行在线合作。毫无疑问，基于云的合作将成为基因组学研究未来的一部分。通过firefly，研究人员可以共享自定义协议，并通过SPT Labtech的验证工具快速验证步骤。以这种新方式促进合作确实触及了科学研究一直以来的核心——研究人员之间的合作会带来更大、更快的突破。因此，我们非常期待看到基于云的合作将如何影响未来的基因组学研究。

保罗·洛马克斯接受了科技网络执行编辑劳拉·兰斯顿的采访。188金宝搏备用