国际大脑蛋白质组项目使用力量Daltonics”增强ProteinScape™功能

在人类蛋白质组组织(国际)第四届年度世界大会,力量Daltonics,已经宣布,国际人类大脑蛋白质组项目(BPP)生物信息学委员会决定包括关键特性的力量Daltonics”ProteinScape™数据库解决方案国际蛋白质组学项目管理BPP的标准数据后处理的指导方针。

这些功能包括ScoreBooster™, Metascore™和ProteinExtractor™,总共预计将进一步改善的质量和验证信息和知识获得的蛋白质组学项目。

ProteinScape旨在通过优化和验证策略生成高质量的信息在每一步的质谱数据解释的过程。

肽质量指纹(及光谱与ScoreBooster预处理,设计一个算法,结合数据校准的步骤,消除calibrant信号和蛋白质以迭代的方式搜索,从而显著改善蛋白质的识别速度。

ProteinScape旨在整合不同的搜索引擎包括吉祥物,Phenyx精深允许交叉验证和识别结果的整合互补使用的几个搜索引擎使用MetaScore算法提供增强的可靠性和增加信心的智能组合得分方案从这些不同的搜索引擎。

蛋白质的评价基于发现的肽ProteinExtractor执行这些搜索引擎的算法生成真正的冗余蛋白质从质/ MS搜索结果列表。
ProteinExtractor减少冗余蛋白质的结果,显著减少手动验证工作。

“这些都是我们自动化的关键特性的方法分析国际BPP试点研究的数据,”博士说基督教Stephan BPP生物信息学委员会鲁尔大学医学对大脑进行蛋白质组学研究蛋白质组学中心。

国际人类的大脑蛋白质组项目的目标(BPP)试点研究是深入了解来自样品实验室分析了世界范围内使用不同的分离和MS技术。

国际BPP数据收集、存储和ProteinScape提交,所选的数据库系统对所有BPP的蛋白质组学项目管理。ProteinScape仍然完全符合所有适用的国际蛋白质组学标准倡议(PSI)标准。

赫尔穆特·e·迈耶教授国际脑蛋白质组项目主任指出:“尤其是,ProteinScape允许我们商店的新特性,处理和分析大量的数据在一个非常有效的方法。”
与力量Daltonics”添加mzData ProteinScape标准格式,质谱数据比较,交换和验证了。mzData格式建立了国际标准的数据交换格式的PSI。

“复杂的生物信息学数据库系统的使用要求的成功管理产生的海量异构数据今天各种各样的工作流方法用于蛋白质组学,”赫伯特·蒂埃尔教授说,生物信息学主任力量Daltonics。

他补充说,“国际BPP后处理工作明确表明需要先进的算法进行数据评估和验证。更多的质量结果产生更多的信心和产生更多的相关知识。”